旋毛虫和弓形虫是两种主要的食源性寄生虫病病原体。旋毛虫主要寄生于肌肉组织；弓形虫则多寄生于脑、淋巴结和肝脏组织。误食受到污染的食物和感染的肌肉组织是两种寄生虫感染宿主的主要方式。为了建立针对旋毛虫和弓形虫的分子检测方法，为弓形虫病和旋毛虫病防控提供合适的检测工具，本研究对两种虫体的常规PCR、Real-time PCR、LAMP三种检测方法进行了研究。　　第一部分根据已发表的弓形虫特异性和敏感性得到证实的529 bp高拷贝序列，设计特异性引物和探针，建立TaqMan探针法的实时荧光定量PCR检测方法；并利用纯化虫体DNA、750份临床样本和与基于靶基因建立的常规PCR和LAMP进行比较。结果发现Real-time PCR、LAMP和常规PCR的检测模板浓度下限依次为：1 fg/μL、10 fg/μL和100 fg/μL。结果表明，real-time PCR灵敏度最高，LAMP次之。　　第二部分根据对旋毛虫11个基因型的核糖体大亚基基因(ls rDNA)序列比对分析，选择其中的种内特异性保守区片段作为靶基因，建立了real-time PCR、LAMP和常规PCR三种分子检测方法。结果显示，三种检测方法的特异性均非常好，检测模板浓度下限分别为：10 fg/μL、100 fg/μL和1 pg/μL。其中real-time PCR灵敏度最高，LAMP次之。此外，采用real-time PCR检测方法定量检测旋毛虫感染小鼠各组织中虫体的拷贝数，结果显示检测取样最好的靶组织是膈肌。以膈肌作为检测对象进行流行病学调查，结果显示集约化养猪场猪旋毛虫的感染率为6.8％，散养猪的感染率高达20％。