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设施菜地是N2O排放的重要来源,主要由微生物的硝化和反硝化过程引起。不同的水肥管理会导致设施蔬菜土壤理化性质的改变,从而对土壤硝化和反硝化微生物产生影响。为了研究不同水肥管理下硝化反硝化菌群结构的变化以及对N2O排放的影响,为设施蔬菜生产找出科学的水肥管理模式,本论文在中国农业科学院顺义试验基地布设了对照处理（CK）、农民习惯处理（FP）、滴灌施肥处理（FPD）、优化滴灌施肥处理（OFPD）4种水肥管理模式。对比分析了土壤有机碳、铵氮、硝氮等理化性质,利用高通量测序的方法研究了土壤中氨氧化细菌（AOB）和古菌（AOA）、nirS型和nirK型反硝化细菌的群落组成,用定量PCR测定AOB和AOA的数量,并用统计学方法分析了环境因子对微生物群落结构的影响。研究获得以下几点结果:（1）OFPD处理土壤各元素（有机碳、速效钾、有效磷、氨氮、硝氮）含量最高,N2O排放量为4.94±1.69 kg·N/ha,高于CK和FP,低于FPD。部分有机肥代替化肥的施用会降低N2O排放量。滴灌减少氮淋溶,土壤氮保存量大,在氮肥投入量相等的条件下,N2O排放量增加。（2）硝化潜势趋势为OFPD>FPD>FP>CK。当硝化潜势增加时,N2O排放量会增加。部分有机肥代替化肥和滴灌显著提高土壤硝化潜势,而N2O排放量相较与FPD却降低,这可能与有机肥施用,增加了土壤硝氮残留量有关。（3）土壤pH值、有效磷含量对AOB的群落结构影响显著（P<0.05）。亚硝化螺菌属是AOB的优势菌属（33.3%50.7%）,OFPD处理丰度最高。有效磷、有机碳的含量对AOA群落结构影响显著（P<0.05）。AOA优势菌属是亚硝化侏儒菌属（17.7%39.6%）,在CK丰度最高。所以,施肥滴灌能显著增加AOB中亚硝化螺菌属丰度,减少AOA中亚硝化侏儒菌属丰度和增加亚硝化球菌属丰度。N2O排放量与AOB和AOA菌落结构变化有显著性影响（P<0.05）。（4）4种管理均是AOA的数量高于AOB的数量。分析发现,施肥能够显著增加AOB的数量,滴灌能够显著增加AOA的数量。当AOB的数量增加时,N2O的排放量会增加。（5）Rhodanobacter（罗河杆菌属）是CK、FP、FPD中的优势菌属,而OFPD的优势菌属是Pseudomonas（假单胞菌属）。施肥滴灌显著改变了土壤中nirS型反硝化细菌的群落结构。Rhizobium（根瘤菌）是nirK型反硝化细菌优势菌属（2.6%10.6%）,施肥滴灌增加了Rhizobium丰度。N2O排放量与nirK型反硝化细菌多样性呈显著正相关（R=0.6034 P=0.0452）,与nirS型反硝化细菌多样性影响不显著。综上所述,不同的水肥管理模式导致土壤AOB、AOA、nirS型和nirK型反硝化细菌群落结构的改变以及AOB和AOA数量的变化,对N2O排放量产生显著影响。部分有机肥代替化肥的施用N2O排放量相对较低,土壤营养元素含量高,是相对比较科学的管理模式。