中国乙型脑炎病毒的基因分型及E基因分子差异的研究

来源 :中国预防医学科学院 中国疾病预防控制中心 | 被引量 : 0次 | 上传用户:boli257758
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该研究对中国分离的21株乙型脑炎病毒进行了基因分型及病毒E基因分子差异的研究.病毒分离株包括中国东起上海西至陕西,北起黑龙江南至云南的广大地区,基本包括了中国乙型脑炎的主要疫区.病毒毒株分离的时间跨度从1949年至2001年,大部分病毒分离于乙型脑炎病人的组织标本,部分病毒分离自吸血蚊虫.21株乙型脑炎病毒复苏后随即进行了病毒生物学特性的初步鉴定.所有病毒均引起BHK细胞病变,乳鼠发病并在3天致死.病毒株SH-80、SH-90致细胞病变及乳鼠发病时间较其它毒株晚,提示这两株病毒与其它病毒有差异.血清学实验显示所有病毒与乙型脑炎病毒的标准抗血清发生反应,提示为乙型脑炎病毒.利用RT-PCR的方法对21株病毒的PreM-E基因分别进行扩增,并将其克隆到pGEM-T载体中进行测序.共获得40,000余碱基的核苷酸序列.按国际上许多学者采用的方法对所有病毒株PreM区的240个核苷酸(乙型脑炎病毒的基因组序列456-695处)进行分析,再结合从国际基因库(GenBank)中获取乙型脑炎病毒相应区段的基因序列,利用生物信息学方法对中国的乙型脑炎病毒进行了基因分型.在对这21株乙型脑炎病毒进行基因分型的基础上,以中国现行使用的乙型脑炎减毒活疫苗株SA14-14-2及灭活疫苗株P3株序列为对照,对决定病毒致病性和抗原特性的E基因区活性结构域进行了核苷酸及氨基酸序列的对比.
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