在对酵母基因上游区调控位点的研究中发现，具有高转录水平的基因几乎都是编码核糖体蛋白的，在低转录水平的基因中却没有发现核糖体蛋白基因，这一现象似乎提示着核糖体蛋白基因上游序列中含有较多潜在的有利于基因转录的转录因子结合位点。为了能够对核糖体蛋白基因上游序列有一个系统而全面的认识，本文采用多种统计方法从不同角度探测了核糖体蛋白基因上游序列中潜在的转录正调控位点，并对它们之间可能存在的协同作用模式进行了分析。 我们先对核糖体蛋白基因和非核糖体蛋白基因上游序列中的寡核苷酸的使用频率进行了统计比较分析，抽提出核糖体蛋白基因上游序列中过表达的(over-represented)寡核苷酸，并结合实验研究和其他方法得到的转录因子结合位点的信息，这些过表达寡核苷酸中的大部分有可能是核糖体蛋白基因中潜在的转录正调控元件。 我们在观察实验获得的转录调控位点时发现，许多调控位点不是相邻接的寡核苷酸，而是由一对被非保守区域隔开的寡核苷酸构成。而真核细胞中基因转录水平上的调控是复杂而又多变的，一般来说，转录过程中转录因子不是单独起作用，一些转录因子聚集在一起形成复合体，结合位点邻近的两个转录因子彼此之间往往会有相互作用。这样的相互作用可使转录因子更加稳定地绑在结合位点上，这种现象称为协同作用，是组合调控(cornbinatorial control)的一种，实验证实协同作用能极大地提高基因转录的效率，但作用细节尚不了解。于是我们对核糖体蛋白基因上游序列中两位点间距离为10bp可能存在的协同作用模式进行了统计分析。当然，更长距离上的协同作用将进一步研究。