马铃薯纺锤块茎类病毒内蒙古分离株基因序列分析及侵染性克隆的构建

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马铃薯纺锤块茎类病毒(potato spindle tuber viroid,PSTVd)是近几年影响马铃薯生产的重要病原之一,其对马铃薯的产量和品质具有严重的影响,导致马铃薯品种种性退化和品质下降。感染后马铃薯一般减产30%左右,严重的能高达90%。PSTVd具有极高的侵染性,可通过农机具、切刀、种薯切块摩擦等方式进行汁液传播,也可通过介体昆虫、花粉、种子、块茎、水等方式传播。PSTVd能在马铃薯的任何生育时期进行侵染,并表现多种症状。  本研究以从内蒙古采集到的受 PSTVd侵染的病薯为材料,克隆了PSTVd的全长基因,命名为内蒙古分离株(potato spindle tuber viroid-Inner Mongolia,PSTVd-IM),对其序列进行了分析,构建了PSTVd-IM侵染性克隆,主要取得的研究结果如下:  1.获得了PSTVd-IM全长基因,并对其进行了测序的分析。测序结果表明,该序列大小为359bp,其与株系 EF044305.1序列吻合,同源性高达100%。首次报道了我国PSTVd-IM内蒙古分离株。将此内蒙古分离株序列与已公布的128个全长的PSTVd株系,应用 Mega5.1软件构建了系统进化树,确定了该分离物与国内外该类病毒分离物的亲缘关系,发现该分离物与俄罗斯分离物亲缘关系最近。与已发表的PSTVd强株系(U23058.1)、中间株系(AY937179.1)和弱株系(M14814.1)进行了序列比对和二级结构分析,发现 PSTVd-IM与这三个不同致病性株系在中央保守区、致病区和可变区结构域存在差异,说明这些结构域可能与其致病性相关。  2.构建了PSTVd-IM的侵染性克隆。通过对 PSTVd-IM的序列分析,选取 PSTVd-IM的单酶切位点 EagI对 PSTVd-IM进行等长加倍,实现了PSTVd-IM基因组的二倍化,保证了PSTVd-IM起始位点的完整性,为PSTVd-IM的有效复制奠定了基础。  PSTVd-IM的克隆和序列分析为 PSTVd-IM克隆化载体的构建奠定了坚实的基础。PSTVd-IM克隆化载体的构建便于该类病毒接种和突变体的构建,为该类病毒的致病机制和致病特点的研究奠定了基础。
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