工程项目建设过程中，冲突不可避免，部门内部同事经常会产生各种各样的冲突。过高的冲突会降低员工的工作效率与工作满意度，然而企业内合理的冲突水平能够激发员工的积极性，从而有助于提高员工工作绩效。因此在冲突事件中必须选择恰当的冲突管理方式。员工的情绪智力影响其在冲突管理方式的选择，进而影响员工的创新绩效。本研究基于以往学者对一般组织或创新企业员工情绪智力、冲突管理方式和创新绩效的研究，提出了在中国工程行业中员工情绪智力、冲突管理方式与创新绩效三者之间关系的假设，探究了冲突管理方式的中介作用。本研究首先在广泛文献浏览的基础上构建了中国工程行业员工情绪智力、冲突管理方式与创新绩效三个变量之间的关系模型，分别确定了中国工程行业背景下测量三个变量的指标；接着通过邮件和现场调研方式向中国工程行业员工发放了187份问卷，回收和汇总共得138份有效问卷；最后运用相关分析、偏相关分析以及线性回归分析验证本研究提出的假设。数据分析结果表明，在中国工程行业中，员工的情绪智力越高，越可能在部门内部冲突事件中选择整合、折中、支配三种冲突管理方式；员工的情绪智力越高，其个体创新绩效越高；在部门内部冲突事件中倾向于选择整合、折中、顺从三种冲突管理方式的员工，创新绩效越高。其中，整合与折中两种冲突管理方式在员工情绪智力对创新绩效的影响关系中起到部分中介作用。中国工程行业员工在部门内部冲突事件发生后，更偏向于选择整合、折中等比较温和的冲突管理方式，以更好地维系同事之间的关系，充分听取冲突双方的意见，以达成满意的处理结果。因此，在部门内部冲突事件发生后，员工应尽量选择整合、折中的冲突管理方式，与同事能够开诚布公地进行讨论，有效解决冲突事件，保证创新绩效；企业管理者应注重开展培训以提高员工的情绪智力，鼓励其更好地控制自己的情绪，同时提倡以整合和折中方式来管理企业部门内部冲突，以提高员工在工作中的创新绩效。