肺癌转移相关蛋白1(LCMR1)相互作用蛋白的筛选与鉴定

来源 :中国人民解放军医学院 | 被引量 : 1次 | 上传用户:wangjuekenan
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目的:肺癌转移相关蛋白1 (lung cancer metastasis related protein 1, LCMR1)的编码基因是我们实验室采用差异显示技术克隆到的新基因(GenBank ID:AY148462),目前其生物学功能不明确。本实验拟通过蛋白蛋白相互作用研究,寻找与LCMR1相互作用的蛋白,为进一步研究LCMR1基因的功能及其在肺癌发生、发展中的作用提供线索和分子基础。方法:(1)将诱饵质粒pGBKT7-LCMR1转化入酵母菌,检测诱饵质粒有无转录激活活性和宿主毒性,鉴定BD-LCMR1融合蛋白的表达情况。(2)以95D细胞总RNA为模板,采用SMART技术在逆转录酶的作用下合成cDNA第一链,使用长距离PCR扩增ds cDNA片段。(3)将诱饵质粒pGBKT7-LCMR1、95D细胞cDNA文库片段及线性化质粒pGADT7-Rec共转化酵母菌AH109,用营养缺陷型培养基初步筛选阳性克隆。(4)通过反复划线培养及重复检测报告基因激活等方法,去除假阳性克隆。(5)提取阳性克隆质粒,分离并扩增单个文库质粒。将pGBKT7-LCMR1诱饵质粒和单个文库质粒共转化酵母菌AH109,验证其相互作用。(6)回复验证为阳性的质粒测序并进行生物信息学分析。(7)应用免疫共沉淀(CO-IP)技术在细胞内对酵母双杂交结果进行验证,确认蛋白质相互作用。(8)应用融合蛋白沉降(GST pull-down)技术在体外对其结果进一步验证,确定蛋白质相互作用。结果:(1)诱饵质粒pGBKT7-LCMR1测序鉴定正确,经检测诱饵质粒无自激活作用和宿主毒性,Western blot实验证实诱饵质粒可在酵母中正确表达融合蛋白BD-LCMR1. (2)以95D细胞总RNA为模板合成ds cDNA,产物纯化后经1.2%琼脂糖凝胶电泳鉴定,观察到一条明亮的弥散状条带,大小在250bp~6000bp,符合文库构建要求。(3)应用酵母双杂交技术初步筛选到6种蛋白与LCMR1存在相互作用,选取其中3种蛋白(RPL29、GNG5、DEK)进行后续验证与研究。(4)应用免疫共沉淀(CO-IP)技术及融合蛋白沉降(GSTpull-down)技术在细胞内和在体外对酵母双杂交结果进行验证,确定RPL29与LCMR1有相互作用,DEK与LCMR1有相互作用,GNG5与LCMR1无相互作用。结论:(1)重组质粒pGBKT7-LCMR1无自激活作用和宿主毒性,能够在酵母细胞中正确表达,可作为酵母双杂交系统的诱饵质粒。(2)成功构建95D细胞cDNA文库,可用于酵母双杂交系统文库筛选。(3)应用酵母双杂交技术初步筛选到6种蛋白与LCMR1存在相互作用。(4)选取其中3种蛋白(RPL29、GNG5、DEK),采用细胞内和体外实验进行验证,最终确定RPL29与LCMR1有相互作用,DEK与LCMR1有相互作用,为研究LCMR1基因的功能和分子机制奠定了基础。
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