在现代的会计领域里，信息处理技术随处可见。会计数据处理的主要手段已经由原来的手工转变为会计信息系统。会计信息化的快速发展给企业带来巨大效益，大大提高了会计信息数据处理的速度和准确性。但是这样也给注册会计师审计带来了新的变化，提出新的要求，对当前的注册会计师审计方法造成了极大的冲击。尤其企业会计信息化的普及应用，给注册会计师审计带来了更多新的问题和挑战。因此，如何完善当前的注册会计师审计流程来应对会计信息化的普及就显得十分必要。企业实施了会计信息化之后，注册会计师审计流程与传统的审计流程就会存在明显的差异。因此，注册会计师的审计能力必须达到更高的水平。身为注册会计师不单要学会传统的审计手段，还应当负责检测会计信息系统的所有程序软件，以此来验证其信息系统的安全性和可靠性。被审计单位的内部控制也是一个应当被审计重点关注的环节。针对此环节，审计人员应当设计合理的符合性测试。本文主要采用了理论联系实际的研究方法，重点阐述会计信息化下注册会计师审计流程。同时以M服务区审计项目为例，将审计流程变为实务讲述.通过具体列示工作底稿，使会计信息化下注册会计师审计的流程更加明了。