羟喜树碱结合肽的实验与模拟计算研究

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通过羟喜树碱的结合肽研究,分析羟喜树碱结合肽的同源序列模式及其与羟喜树碱的结合机制,寻找羟喜树碱的结合蛋白质,为深入探究关于羟喜树碱的抗癌机制、耐药机制和毒理机制提供帮助。酯化脱水法制备生物素化羟喜树碱,使用Resourse15反相柱纯化,液质联用分析确证。SRB法鉴定生物素化羟喜树碱的抗癌活性。利用生物素化羟喜树碱包被的亲和素磁珠,采用噬菌体展示技术筛选得到十四条羟喜树碱结合肽,利用序列比对分析得出羟喜树碱结合肽保守性序列模式为xxxxxLxPxxxx,简并羟喜树碱结合肽保守性序列模式为xGxxGGGNxGGx。经生物信息学比对分析得到一系列肿瘤相关羟喜树碱结合蛋白,主要包括癌基因蛋白,癌基因靶标蛋白,癌基因调节蛋白,肿瘤特异性抗原,跨膜受体及受体相关蛋白,转录因子,两种受体型蛋白酪氨酸磷酸酶,一种G蛋白偶联受体,一种磷脂酰肌醇磷酸激酶,一种信号激活增殖相关蛋白等多个信号通路调节靶点以及肿瘤耐药蛋白等。构建并优化了羟喜树碱结构模型。构建并通过分子动力学优化了羟喜树碱结合肽结构模型。使用分子对接验证并分析了羟喜树碱与羟喜树碱结合肽的结合作用。
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