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改革开放以来,我国高校利用科技和人才优势创办科技企业,在加速科技成果转化和产业化方面取得了显著成绩,已成为我国发展高科技、实现产业化的重要力量。为了化解高校校办产业发展过程中凸现的问题和风险,建立以资本为纽带,产权清晰、权责分明、校企分开、管理规范的新型高校企业管理体制和运行机制是教育体制改革的必由之路。成立高校资产经营管理公司,并通过行政划转方式建立以资产经营公司为母公司的高校产业集团的组织形式是高校发展科技产业的一种管理创新,也是高校科技产业管理体制改革的具体实践。通过财务控制系统的建立和完善,发挥资产经营公司对校办企业财务运行状况的监控作用,是加强高校经营性资产管理的需要,也是推动高校产业健康发展的关键。由于高校产业管理体制改革还刚刚起步,高校资产经营公司的组建和在实践中的运作尚在探索之中,对高校资产经营公司的管理控制理论还缺乏系统、深入的研究,特别是母子公司财务控制理论在中国高校校办产业领域的研究更是一个全新的课题。作为校办产业集团母公司的高校资产经营公司在实施集团财务控制方面有其特殊性,对高校产业领域内母子公司实施财务控制的模式和手段进行研究,探讨母子公司财务控制系统的优化对策具有重要的理论和实践意义。本文以现代管理学的基本原理为指导,运用财务管理的基本理论和方法,从高校产业体制改革与资产经营公司的形成入手,对高校资产经营公司的性质及财务特征进行了深入剖析,将母子公司财务控制理论与高校资产经营公司的特殊性相结合,运用授权经营理论、委托—代理理论和出资者财务理论对高校资产经营公司财务控制的必要性和主要内容进行分析。然后通过对C大学资产经营公司实施财务控制的案例研究,挖掘出高校资产经营公司财务控制方面普遍存在的问题,用理论指导实践,探索适合高校资产经营公司经营特点的财务控制模式。最后运用比较分析法,对各种财务控制的实现手段进行深刻的比较分析,就各种手段如何选用和融合提出自己的观点。并通过对不同控制手段的分析比较,使之相互融合,取长补短。通过本文的研究,力图搭建一个有效的财务控制系统,并探索出高校资产经营有限公司既能对子公司加强财务管理,实施有效的控制,又能激励子公司共同实现财务目标的财务管理模式。