半个世纪以来，随着研究的不断深入，已有多种模型用于基因调控网络的构建，包括布尔网络模型、贝叶斯网络模型、微分方程模型等，并取得了一些成果。20世纪90年代，基因芯片等高通量生物技术的应用产生了海量的生物数据，为基因调控网络构建的研究创造了更加有利的条件。如何有效地利用这些数据，成为近期研究的热点。目前比较有效的途径是将不同的实验数据进行集成，在集成的基础上对网络进行建模，然而现有的数据集成方法还存在一些不足，例如：数据之间相关特性未得到充分利用等。针对以上问题，本文对基因敲除和基因微扰数据相集成的网络构建方法进行了研究，主要完成了以下工作：1.分析并总结了已有的数学模型应用在基因调控网络构建中的优缺点；2.对现有的基因敲除和基因微扰数据相集成的方法进行改进，根据预测结果的重叠程度赋予不同可信度，以充分利用数据之间的相关特性，提高构建网络的覆盖率；3.针对以上建立的改进的数据集成方法，提出了基于Floyd算法解决级联问题的方法，以最长路径为间接路径，通过概率比较对两种路径进行区分，以提高总体预测性能；4.在以上两种方法的基础上，实现了基于数据集成的基因调控网络构建实验系统，验证了方法的有效性。最后，对所做的工作进行了总结，并对以后将要研究的内容进行了展望。