BSP测序检测青海地区汉、藏族胃癌患者中TGFBI的甲基化状态

来源 :青海大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:C_Adrian
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目的:通过检测胃癌(Gastric cancer,GC)患者癌组织及与之相匹配的癌旁组织中TGFBI基因启动子甲基化状态,探讨TGFBI基因甲基化与GC发生、发展的关系。通过民族间的比较,探讨汉族、藏族GC患者之间TGFBI基因启动子甲基化是否具有差异性,为青海地区GC高发及民族间发病率存在差异的可能原因提供相关理论数据。方法:1.收集2019年03月至2019年11月于青海大学附属医院住院并行胃镜活检,首次病理确诊为GC的患者28例。其中,GC组织样本和配对癌旁组织样本各28个。2.依据民族不同分组:汉族17例,藏族11例。3.采用亚硫酸氢盐测序(bisulfite sequencing PCR,BSP)法检测各样本TGFBI基因启动子甲基化程度,并进行统计学分析。结果:1.GC组织TGFBI基因启动子甲基化克隆数478个,甲基化率为11.42%;癌旁组织TGFBI基因启动子甲基化克隆数293个,甲基化率为6.98%;GC组织甲基化程度高于与其相匹配的癌旁组织,差异具有统计学意义(P<0.05)。2.汉族、藏族GC组织中,汉族TGFBI基因启动子甲基化克隆数299个,平均甲基化率17.73%;藏族TGFBI基因启动子甲基化克隆数179个,平均甲基化率10.95%,汉族、藏族GC患者癌组织间TGFBI基因启动子甲基化差异不具有统计学意义(P>0.05)。3.汉族、藏族配对癌旁组织中,汉族TGFBI基因启动子甲基化克隆数208个,平均甲基化率8.16%;藏族TGFBI基因启动子甲基化克隆数85个,平均甲基化率5.15%,汉族、藏族GC患者癌旁组织间TGFBI基因启动子甲基化差异具有统计学意义(P<0.05)。4.收集临床病理资料分析:GC组织中TGFBI基因启动子甲基化程度与患者的性别、年龄及肿瘤的病理分化、浸润深度、转移、TNM分期均无统计学意义(P>0.05)。结论:1.GC患者癌组织TGFBI基因启动子甲基化程度显著高于配对癌旁组织,考虑TGFBI基因高甲基化可能参与GC的发生、发展。2.汉、藏两民族GC患者TGFBI基因甲基化程度在癌旁组织间存在差异,在癌组织间无差异,考虑TGFBI基因高甲基化可能与早期GC发展有关,这对早期GC诊断的研究方向及探讨基因甲基化对民族间GC发病率的影响提供一定参考。3.GC组织TGFBI基因启动子甲基化程度在患者GC转移、TNM分期中无差异。
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