支气管上皮细胞基因组DNA拷贝数异常对周围型不吸烟肺腺癌患者鉴别诊断价值的初步探讨

来源 :中国协和医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:a372092
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腺癌发病率逐年提高。周围型肺腺癌为临床诊断的一个难题,目前缺乏有效易行的鉴别诊断手段。有关区域性癌化现象在气道上皮细胞中的研究表明,形态正常的气道上皮细胞分子水平的改变可以用来辅助诊断肺癌,但是针对不吸烟肺腺癌患者的相关研究很少。本课题在实验室已有的稳定的微阵列比较基因组杂交技术(array comparative genome hybridization Array-CGH)平台基础上,研究不吸烟周围型肺腺癌患者与良性周围型疾病患者的支气管上皮细胞基因组DNA拷贝数异常的变化情况,以期获得NSPLAd患者及PBPD患者支气管上皮细胞基因组DNA拷贝数改变谱型;进而揭示NSPLAd患者支气管上皮的特征性改变的基因或DNA片段,并以这些DNA片段的组合来进行NSPLAd患者的鉴别诊断,以指导正确治疗。首先,应用Agilent Human Genomic CGH 44B芯片,对16例患者(11例NSPLAd,5例PBPD)的32个部位的支气管上皮细胞刷片(每位患者包括健侧叶段支气管上皮细胞-1s及患侧主支气管上皮细胞-2s)基因组DNA进行了Array CGH检测。继而,采用Agilent CGH Analytics 4.0和GeneSpring GX 11.0.1分析软件分析实验数据。结果显示:(1)11个NSPLAd患者支气管上皮细胞基因组DNA拷贝数发生异常的区域较一致,1s发生频率大于45%片段有15个,2s发生频率大于50%的DNA片段有10个。(2) NSPLAd患者与PBPD患者对应的支气管上皮相比,基因组DNA拷贝数变异的区域广,范围大,发生频率高。(3)经过对11例患者2s处Array CGH实验数据的生物信息学分析,初步筛选出34个能用于鉴别诊断NSPLAd患者的DNA片段组合。综上,本研究表明,NSPLAd患者形态正常的支气管上皮中存在一系列基因组DNA拷贝数变异,2s处基因组DNA拷贝数变异可能用于NSPLAd的辅助诊断,有望通过进一步扩大样本量的深入研究建立起能够用于NSPLAd鉴别诊断的分子模型。
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