馈线保护是牵引供电系统的基本保护之一。保护算法是馈线保护的软件核心，对提高保护装置的性能起到重要作用。　　 论文重点分析了滤除衰减直流分量的改进傅氏算法原理，将改进全波算法分为3类进行研究和仿真。通过比较改进算法的精度和速度，选择出改进全波算法5作为保护装置的采样算法。其后，探讨并仿真实现了加窗插值傅氏算法，测试其抑制频谱泄漏的性能。同时，简要分析了其他采样算法原理。　　 在功能算法方面，主要对自适应距离保护和电流速断保护进行了研究。对馈线保护阻抗多边形进行了改进，并用变电所现场运行数据进行仿真测试，测试结果证明了改进阻抗多边形的正确性。探讨了馈线异相短路故障时，保护拒动的原因和改进算法。提出电力系统自适应电流速断保护对电铁馈线的电流速断保护具有借鉴意义并仿真。文章对其他功能算法也进行了阐述。　　 为了对算法进行实际验证，采用Samsung公司的S3C2410为CPU、嵌入式Linux为操作系统，设计保护装置的硬件系统和软件系统。并采用牵引变电所现场运行数据，模拟完成了保护算法程序的测试，试验结果表明：中断采样程序在信号中含有衰减直流分量时，能够正确计算电气参数。故障处理程序在故障状态和正常状态下都能够做出正确的判断。从而证明了算法程序的正确性。