一直以来,高等教育对于社会进步、发展经济、以及文化事业的发展都具有重要的促进作用。高等教育不仅能够为社会总体发展提供高素质的合格人才,更是创新的源泉,能够为科学研究和创新能力提供保障,因此高等教育发展意味着一个国家或地区经济和人员素质的进步。并且是在以知识为基础的全球经济环境中,决定着一个国家的核心竞争力,及高等教育的发展对于一个国家或地区的发展起重要的推动作用。因此,各国均非常重视高等教育的合理投入和有效的产出。随着高等教育规模的扩大,研究者与社会公众开始重视高等教育办学效率。新疆高等教育事业发展相对落后于国内其他省市的高等教育发展,且存在投入不足、人均教育资源占有量少、投入效益低等现象。这逐渐成为制约我区教育和经济社会发展的障碍。因此如何能够使稀缺的资源投入用到恰处,得到更好的产出效率成为亟待解决的重大问题。同时,实行跨越式发展的当今,增强我区高等教育投入结构、优化我区高等教育产出效率对于新疆高等教育的发展和经济增长的带动作用也处于待研究。因而,研究新疆高等教育投入和产出效率问题及高等教育的发展对于我区经济发展中的作用成为引起社会各界和政府的注意力的重要现实问题。经调查数据显示,到了2013年,新疆高等院校在校生达到295 292人,其中11所本科院校在校生达到203 193人,占总数的69%。因此,本文选取最为代表性的新疆11所普通本科院校为研究对象,依据人力资本理论、经济增长理论,采用教育经济学、统计学、经济计量学相关理论方法,分析和研究高等教育投入与产出之间的对应关系,并且为此建立了评价新疆高等教育投入和产出效率的指标体系。以此为基础分析和衡量高等教育投入与产出效率,并分析新疆高等教育发展与经济增长之间的相互依存、共同发展关系。本文以新疆11所普通本科院校的投入和产出因素为研究对象,运用数据包络分析方法(DEA)进行效率分析。运用DEA基本模型对于11所高校进行效率的测算。第二步,针对技术有效的高校再进一步运用DEA超效率模型进行超效率分析,并根据效率值的大小进行排序。得出部分高校处于资源浪费和产出效率较低或无效状态,同时对此进行因素分析并提出解决问题的对策建议。