组蛋白去甲基化酶JARID1B、JMJD3、KIAA1718的发现与鉴定

来源 :中国科学院生物化学与细胞生物学研究所 中国科学院上海生物化学和细胞生物学研究所 中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细 | 被引量 : 0次 | 上传用户:skycliff520
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
在真核细胞中,染色质是遗传物质DNA的贮存场所,其基本结构元件是核小体。核小体由四种核心组蛋白(H2A,H2B,H3和H4)和与之缠绕的146个碱基的DNA共同组成。每个核心组蛋白的N端都游离于核小体之外,N端的精氨酸、赖氨酸等位点可被甲基化、乙酰化。这两种修饰具有很重要的生物学功能。   其中,组蛋白的甲基化修饰在调控染色体的动态结构及其转录功能上发挥重要的作用。组蛋白甲基化对基因的表达、异染色质的形成、X-染色体失活、DNA的修复和细胞的行为、命运等有重要的作用。组蛋白的甲基化常发生在赖氨酸的ε氨基或是精氨酸的胍基上。每个赖氨酸有3种不同的甲基化状态,即一个甲基(一甲基),两个甲基(二甲基)或三个甲基(三甲基)通过化学键偶联到赖氨酸侧链上的ε氨基团上,精氨酸可以被一甲基化或二甲基化。组蛋白H3的R2、K4、R8、K9、R17、R26、K27、K36、K79和H4的K20均可被甲基化。根据甲基化修饰的位置残基和修饰状态,组蛋白甲基化与基因的激活或抑制转录相关。   一直以来组蛋白的甲基化被认为是一种稳定的修饰,但是近来的研究证明并非如此。自2004年Yang Shi及其同事发现了第一个真正意义上的组蛋白去甲基化酶LSDl以来,组蛋白去甲基化酶的研究开始兴起。但Yang Shi及其同事发现的去甲基化酶只能去除赖氨酸的一甲基和二甲基,而不能催化去除三甲基化。2006年,Yi Zhang及其同事发现了另一个家族的组蛋白去甲基化酶,这类家族拥有JmjC结构域做为其催化中心,可催化去除三甲基化,这一发现掀起了组蛋白去甲基化酶研究的高潮。   在本研究中,我们首先利用生物信息学手段从NCBI数据库中搜索到30个含有Jmjc结构域的蛋白,并从中挑选了尚未报道的三个基因JARIDlB、JMJD3、KIAA1718作为候选的组蛋白去甲基化酶。体内免疫荧光实验显示JARIDlB有H3K4me1、H3K4me2、H3K4me3去甲基化酶活性;JMJD3有H3K27me3和H3K27me2去甲基化酶活性;KIAA1718有和H3K9me2、H3K27me2去甲基化酶活性。体外组蛋白去甲基化酶活性测定实验证实这三个蛋白为组蛋白去甲基化酶。进一步实验发现其重要的结构域和催化机理。   组蛋白甲基化修饰抗体是研究组蛋白甲基化修饰的非常重要的试剂。但是,目前一部分商业化抗体的质量和数量都达不到研究的需要。因此,在本研究的第二部分工作里,我们制备与鉴定了42个特异的组蛋白甲基化修饰抗体。从设计组蛋白甲基化修饰的多肽序列开始,到免疫兔子,提取血清,亲和纯化得到抗体,再通过Dot Blot、Mini Blot、免疫荧光等实验检测抗体的特异性和效价,最后我们制备和鉴定了以下抗体:   H3R2(me1),H3R2(me2s),H3R2(me2a);   H3K4(me1),H3K4(me2),H3K4(me3);   H3R8(me1),H3R8(me2a),H3R8(me2s);   H3K9(me1),H3K9(me2),H3K9(me3);   H3R17(me1),H3R17(me2a),H3R17(me2s);   H3K18(me1),H3K18(me2),H3K18(me3);   H3K23(me1),H3K23(me2),H3K23(me3);   H3R26(me1),H3R26(me2a),H3R26(me2s);   H3K27(me1),H3K27(me2),H3K27(me3);   H3K36(me1),H3K36(me2),H3K36(me3);   H3K56(me1),H3K56(me2),H3K56(me3);   H3K79(me1),H3K79(me2),H3K79(me3);   H4R3(me1),H4R3(me2a),H4R3(me2s);   H4K20(me1),H4K20(me2),H4K20(me3)。   这些抗体大部分特异性很好,可以做WB、IF甚至ChIP实验,这将为组蛋白甲基化的研究提供很好的工具和平台。
其他文献
一个人要像一支队伍rn张爱玲笔下的白家六小姐,长着一双“娇滴滴,滴滴娇的清水眼”.2009年,陈数演活了《倾城之恋》中的白流苏,她往那儿盈盈一立,眼波流转时,柔婉动人,百媚丛
期刊
肿瘤微环境中存在着大量促血管生成因子,其所诱导的肿瘤血管生成是肿瘤发展和转移的重要步骤。我们实验室之前的研究以及其他实验室的研究都发现内皮细胞粘附分子CD146可能参
学位
她看起来消瘦、虚弱、敏感,风衣的兜帽被拉上去,盖住她那灰白的长发,就像一个修道士的头罩,她紧握着一本书,神情严肃,仿佛那是一本教义问答手册.但几分钟以前,当她站在舞台的
期刊
没有什么比腕表更能体现出“专业感”了;在致力于成为自己所在领域“专家”的过程中,我们在腕表的审美和选择上也愈发倾向于体现出专业性,或者至少,更加关注腕表的功能.春天
期刊
期刊
去年,美国、英国和中国继续保持全球三大主要艺术交易市场的地位,美国市场依旧是全球最大艺术交易市场,占据全球44%的销售额.rn千禧一代的偏好正在引领一场革命,从共享骑行、
期刊
期刊
期刊
随着3G无线通信技术的飞速发展,将会产生越来越多的无线用户,越来越丰富的无线服务以及越来越高的数据带宽要求,这将与有限的频谱资源之间产生突出矛盾。为了在有限的频谱范围内
Ⅲ族氮化物半导体近年来被大量研究,因其优异的材料特性成为目前主流材料之一,被广泛地应用于发光二极管(LED)、半导体激光器、太阳能电池等方面。Ⅲ族氮化物半导体LED是21世