自1990年6月国务院批准成立中国第一个保税区一一上海外高桥保税区以来，我国的海关特殊监管区域历经了出口加工区、保税物流园区、保税港区、综合保税区的逐步发展与蜕变，值得庆贺的是在2013年8月，中国第一个自由贸易区-中国（上海）自由贸易试验区经国务院正式批准设立。然而自由贸易区毕竟还处在试验阶段，相对来说综合保税区发展的更为成熟，作为中国除自由贸易区外开放层次最高、优惠政策最多、功能最齐全、手续最简化的特殊开放区域，综合保税区的发展对促进国际贸易和国际物流的发展，带动周边地区的发展以及国民经济的提高，具有十分重要的战略意义。但是中国的综合保税区在政府管理体制方面还存在不少问题，比如在中央政府管理机构方面缺乏一个专门对保税区、综合保税区等进行统一地监督管理的宏观机构，在宏观角度，对保税区的设立、发展以及日常经营活动进行管理，履行其宏观层次的管理职能；在地方政府管理机构方面存在多个政府机构同时管理，但是却缺乏统一协调机构这样一个多头管理问题。除此之外，我国保税区在政府管理方面还存在我国政府管理所共有的一些问题，比如政府管理的管理理念比较陈旧，政府管理的管理方法比较落后，不能满足现阶段保税区发展的需要。我国保税区在政府管理方面存在的这些各种各样的问题，阻碍了保税区的发展和转型，解决这些问题，建立一个合理高效的政府管理体制至关重要。此文就以郑州新郑综合保税区为研究对象，首先，从国外自由贸易区与国内保税区的概念界定入手，指出了不同组织或者会议对自由贸易区的内涵不同的理解和定义，还有我国所特有的保税区的定义与内涵，然后介绍了我国其他海关特殊监管区域的情况。其次，比较了中国几个著名的综合保税区的基本状况和功能定位情况，比如上海浦东机场综合保税区、北京天竺综合保税区以及苏州工业园综合保税区，得出综合保税区的功能应该根据其具体情况来定位的结论，所以此文在第四部分对郑州新郑综合保税区的区位优势和产业优势进行了分析，才将郑州新郑综保区的功能定位为：保税物流功能、保税加工功能、货物贸易功能、服务贸易功能；再然后，此文对中国保税区的管理模式现状进行了分析，包括我国保税区的政府管理体制以及这种体制的缺陷和弊端，又对国外自由贸易区通行管理模式进行了总结，主要分为三种模式：企业主导型，政企合一的政府主导型，政企分开的政府主导型，然后在此基础上对郑州新郑综合保税区的管理模式提出了新的构想，即混合型管理体制，分析了其原因。最后，此文指出，由于在我国社会主义市场经济体制逐渐确立的情况下，传统的政府管理模式已经不能适应当前我国的国情，为了避免传统政府管理制度的弊端和缺陷，我国正在积极推行与社会主义市场经济体制相适应的政府管理体制改革，创新政府管理模式，转变政府职能。与此相适应的，我国保税区政府管理方面也要相应进行改革和创新，因此在文章最后提出了一系列政府管理的创新措施。