【摘 要】
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本研究采用PCR扩增线粒体基因组后,通过PCR产物直接测序,获得并分析了稻蝗二属四种的线粒体基因组,同时也获得了其内部的序列特征以及组织架构,其中所涵盖的就是控制区和基因
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本研究采用PCR扩增线粒体基因组后,通过PCR产物直接测序,获得并分析了稻蝗二属四种的线粒体基因组,同时也获得了其内部的序列特征以及组织架构,其中所涵盖的就是控制区和基因排列顺序以及碱基组成等情况,同时还包含了氨基酸以及密码子的具体状况。分析进化特征以及他们之间的系统发育关系。结果如下:1.小稻蝗(Oxya hyla intricata)、中华稻蝗(Oxya chinensis)、赤胫伪稻蝗(Pseudoxya diminuta)以及日本稻蝗(Oxya japonica),这些物种其线粒体基因组都是呈现出双链环状分子的架构,同时对基因组进行了解发现其序列总计长度为是15 174bp、15486bp、15 429bp、15 089bp。基因的组成以及基因顺序和目前已公布的斑腿蝗科(Catantopidae)物种相同,其中涵盖了同其他节肢动物相同的基因,而其基因数量达到了37个,除此之外还包含了A+T富集区,其数量为1个。这同现在检测完成的线粒体基因组有较高的同源性。2.四个物种所有蛋白质编码基因均为典型的ATN起始密码子;除了ND5本身属于不完整终止密码子T,剩下的所有蛋白质编码基因都是属于比较完善的终止密码子TAG以及TAA。3.以64个物种的13个蛋白质编码基因为基础,选取半翅斗蟋(Velarifictorus hemelytrus)、华北蝼蛄(Gryllotalpa unispina)、中华螽斯(Tettigonia chinensis)和云斑车蝗(Gastrimargus marmoratus)作为外群,然后利用最大似然法(ML)构建系统发育树。结果显示:整个聚类树主体分为三个聚类簇,稻蝗属属于第三大聚类簇,并且位于聚类树的根部,与外类群具有较近的遗传距离。4.四个物种tRNA其自身的二级结构都是非常保守的。其中不论是氨基酸和反密码子环以及T?C环等,均会产生不同程度碱基的错配变异。5.用线粒体基因组13个蛋白质编码基因的氨基酸序列的联合数据集构建了系统发育树,在本次的研究中主要使用的方法是以ML分析方法为主,基于此方法而得到拓扑结构,其中形态以及结果具有相似性。本论文针对于昆虫以及直翅目线粒体基因组的内部序列和架构进化具有一定的参考作用。
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