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本研究利用26个微卫星座位统计了新扬州鸡品系内的等位基因组成,计算了各座位的基因纯合率和多态信息含量(PIC)及平均杂合度。结果表明26个座位的平均基因纯合率为64.3%,平均PIC为0.337,平均杂合度为0.375。结果显示,新扬州鸡具有一定的遗传稳定性,已成为一个稳定的遗传群体,符合封闭群动物的遗传特征。 7个微卫星座位ADL102、ADL172、ADL290、MCW5、MCW58、MCW104、MCW123与新扬州鸡0~6周龄体重的相关分析表明,在亲代和F1代群体中,MCW58座位对新扬州鸡母鸡2~6周龄体重有显著影响;MCW123座位在亲代试验中对新扬州鸡母鸡2~6周龄体重有显著影响,而在F1代中影响不显著。 在本次试验中,我们发现在一定的蛋白范围内,新扬州鸡的早期生长与蛋白水平或质量都不呈线性关系。但是日粮蛋白水平对新扬州鸡体重却有显著影响。低蛋白组显著大于中蛋白组,与高蛋白组体重差异不显著。低蛋白组采食量最多,高蛋白组采食量最少。 同时,不同的蛋白水平条件下,微卫星座位MCW58的不同基因型对2~6周龄母鸡体重的效应值并没有显著的变化,说明在其附近存在的影响新扬州鸡早期生长发育的QTL并不受蛋白水平变化的影响。