新常态下技术创新在实现经济长期可持续发展中变得至为关键,创新已成为一个国家核心竞争力的根本体现。理论研究和实践表明金融发展和金融结构对创新的作用和影响日益突出,已成为决定一国（地区）技术进步与创新的重要因素。金融作为现代经济的核心,众所周知我国的资本市场和信贷市场经历了跨越式发展,源于创新驱动模式,而我国的技术创新的绝大部分是在企业创新,更加亟需合理的金融结构为企业提供资金支持,以此加快新常态下的经济增长。绝大多数学者研究的主要集中于探索不同地区或国家的金融结构对技术创新的支持作用,而探讨对自主创新和模仿创新的固定效应的研究相对缺乏,为本文提供了新的思路和视角。本文创新性的角度讨论自主创新和模仿创新对正在依靠创新驱动发展战略,以模仿创新转换为以自主创新是我国向技术领先国家发展的必经之路,以此来实现转型升级。加之互联网金融中介的出现和我国经济腾飞,则对原有金融结构构成了巨大的挑战,本文在全国层面的研究基础上,进一步研究对技术创新影响的区域差异,使本文的研究更有针对性。本文从股票市场发展水平、信贷市场发展水平、金融发展效率三个维度来衡量金融结构。专利授权数量在本文用以衡量技术创新,而将专利分为三类:发明专利、实用新型专利、外观设计专利,这三类专利根据国家知识产权局说明的申请难度和创新含量递减,按其保护的程度划分为自主创新和模仿创新。本文是使用2000-2019年期间全国的各省专利数据以及金融统计相关数据,应用静态面板数据,由于各变量在不同省份不均衡发展,因而为识别金融结构与技术创新的关系提供了横截面维度的数据。研究表明差异化的融资方式会有不同的应用场景,目前我国的金融结构主要是信贷市场为主,这种金融结构有利于促进模仿创新,而不利于自主创新的产出,以资本市场为主导的融资类型在很大程度上为自主技术创新创造了适宜的生长和发展环境;而金融发展效率在短期内虽不利于地区的经济增长,但有助于加速地区技术创新水平的提升,长此以往地成为经济增长的引擎。空间自相关检验分析表明,上海、江苏、广东、北京、浙江等地属于创新产出高的地区,而云南、西藏等地属于创新产出低的地区。源于东部、中部地区的自然环境、区位优势以及各省份金融结构政策等明显优于西部地区,资金汇聚于发达地区,致使金融发展的差距进一步扩大,导致技术创新产出高于西部地区,这一结论也符合中国实际情况。本文的政策含义是加快中西部地区的金融服务体系,从而能够将资本市场和信贷市场的作用发挥到最大,同时开辟多元化的渠道融资,唯有全面竞争的市场能提升资源配置效率,并激发技术产业的自主创新,带动企业的技术创新蓬勃发展。