论文部分内容阅读
目的： 长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）在调控心血管疾病的发生发展过程中发挥了重要作用。但目前对于Stanford A型主动脉夹层（Stanford type A aortic dissection，TAAD）的发病机制研究尚不透彻。我们通过基因芯片筛查在TAAD发病机制中可能的关键的lncRNA。 方法： 1．通过基因芯片，比较正常主动脉组织与Stanford A 型主动脉夹层患者的主动脉组织的lncRNAs与mRNAs表达谱，以差异倍数（FC）≥1.5，P值＜0.05为标准，筛选出正常主动脉组织和TAAD主动脉组织中差异表达lncRNAs和mRNAs。 2.对存在差异表达mRNAs进行功能富集分析（GO Enrichment Analysis）和信号通路富集分析（Pathway Enrichment Analysis），获得正常主动脉组织和TAAD主动脉组织中差异表达mRNAs所参与的显著性功能和信号通路。 3.建立lncRNA-mRNA共表达网络，找到差异表达的lncRNA可能的靶基因；分析差异表达lncRNA与mRNA的所处的基因位置关系，推测差异表达lncRNAs可能相关的靶基因。 4．选取degree较高的lncRNAs进行qRT-PCR技术验证。 5.对正常主动脉组织和TAAD主动脉组织的组织中膜做HE染色，观察细胞排列情况。 结果： 1.在正常主动脉组织和TAAD主动脉组织之间一共识别出24043个lncRNAs和23863 个mRNAs。其中差异表达的lncRNAs有253个，mRNAs有1451个（FC≥1.5，P＜0.05）。 2．通路富集分析表明，在TAAD患者的主动脉组织中的下调的mRNA涉及43条通路，而上调的差异mRNA涉及41条通路。功能富集分析表明，在TAAD患者的主动脉组织中下调的mRNAs主要与细胞外基质组织有关，而上调的mRNAs主要与炎症反应有关。 3.linc-ERAP1，NR_027823，linc_luo_1410，linc_luo_1506，NR_033438，NR_029372，linc_luo_1828，这是lncRNA-mRNA共表达网络中7个degree最高的lncRNA，可能在共表达网络中扮演核心角色。 4． 与正常升主动脉组织相比, linc00670,linc01212,loc283140,PGM5P2,这四个lncRNAs的在TAAD主动脉组织中的表达水平与芯片结果一致。这些数据支持qRT-PCR结果与基因芯片数据之间的一致性。 5．HE染色结果表明在正常组主动脉中膜，动脉管壁的细胞排列结构致密，单层结构清晰，胞质着色鲜红，在TAAD主动脉组织中膜中，动脉管壁的中膜结构较为松散，单层结构之间间隙较大，胞质着色暗淡，弹性纤维紊乱，不规则。 结论： 正常主动脉组织和TAAD患者的主动脉组织中存在大量差异表达的lncRNA与mRNA，涉及丰富的通路与功能。本研究发现部分lncRNA可能参与Stanford A型主动脉夹层的发病机制。