党的十八届三中提出:“鼓励和引导工商资本到农村发展适合企业化经营的现代种养业，向农业输入现代生产要素和经营模式”。从2012年起，随着“网易养猪”这样新鲜的词汇逐渐在新闻上开始出现，城镇工商业资本逐渐将眼光投向广大农村。与此同时，伴随工业化与城市化的推进，广大中西部农村地区，劳动力被大量吸走，土地资源开始闲置下来。在中央到地方的政策鼓励下，闲置的土地与闲置的资本两种要素结合在一起，学者称之为“资本下乡”。　　本文试图从湖北J镇的个案调研出发，探讨资本作为一个外来的特殊的要素，进入到两湖地区原子化的村镇之后，在招商引资、土地流转和规模经营三个不同进程中分别会给基层治理带来负面影响。在招商引资进程中，笔者调查发现，基层治理原本顶层设计的，通过行政压力推动的“被动性”的公共性治理目标很可能会被基层组织“自发性”的自利性治理目标所替代，产生目标替代的治理困境;而在土地流转进程中，原本村庄乡土性的治理权威在基层干部、资本与村民的三方互动中逐渐被商业权威俘获和替代，导致基层治理权威的转换;在农业规模经营阶段，原本作为农资矛盾中介与协调者角色的基层组织在农资矛盾逐步激化的过程中一步步沦为资本的代理人，导致基层组织的角色冲突和矛盾。三个进程中的三种治理困境都将通过不同的途径直接或间接地冲击到整个基层治理的秩序。本文最后对症下药，浅要地针对资本下乡三个进程中的三种不同的治理困境分别提出三个策略，实现基层治理的困境突围。