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本论文研究了影响非修饰性寡核苷酸芯片性能的各种因素，如固定方法，玻片载体，非修饰性寡核苷酸探针浓度，靶目标的浓度，非修饰性寡核苷酸探针长度，点样液和封闭作用。根据实验结果，构建了稳定性和重复性都很好的非修饰性寡核苷酸芯片平台。将这一平台技术应用于人类白细胞表面抗原的基因分型上。在本论文中，根据HLA-DQA第二外显子基因序列的多态性，设计了一套寡核苷酸探针，制成了寡核苷酸芯片。通过分析135个样本的HLA-DQA基因型，结果表明该技术是一种准确，低成本，快捷的方法，与传统血清学分型方法相比，寡核苷酸芯片分型法是一具有优势的方法。这个平台可应用于其他的复杂基因系统。