高质量桃线粒体DNA提取技术体系的建立及线粒体基因组测序

来源 :河北科技师范学院 | 被引量 : 3次 | 上传用户:PIPI16
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线粒体为植物体内各项生命活动提供能量,其DNA编码植物体内一些重要酶类和蛋白质。提取高质量的线粒体DNA是线粒体基因组测序的重要前提。本研究以‘21世纪’、‘珲春’、‘早霞露’、‘中华寿桃’、‘Mafirm’、‘瑞光21’6个品种的桃叶片作为外植体,24℃完全避光条件下进行了愈伤组织诱导及增殖。并以获得的‘21世纪’桃愈伤组织为材料,通过匀浆化处理、差速离心和蔗糖衬垫等操作提取并纯化线粒体、利用SDS裂解法等方法提取并纯化mtDNA,最终获得了满足测序要求的‘21世纪’桃mtDNA,建立了一套适合桃的简便快速高效的mtDNA提取技术体系,丰富了蔷薇科果树mtDNA提取的研究。对‘21世纪’桃线粒体基因组进行了测序,初步分析了桃线粒体基因组的特点和基因的功能,为后续开展更广泛、更深入的研究奠定了基础。主要结果如下:1.MS培养基中同时添加6-BA和2,4-D可显著提高6个桃品种愈伤组织的诱导率,缩短诱导时间。当6-BA浓度达到3 mg/L时,诱导率可达到100%,愈伤组织的生长情况良好。最佳愈伤组织诱导培养基为MS+3.0 mg/L6-BA+1.0mg/L2,4-D。2.荧光显微镜检测显示本研究提取的线粒体完整且具有活性。电泳检测显示桃mtDNA条带大小约为23 kb,无降解。核酸纯度分析表明提取的mtDNA无RNA和蛋白质污染。特异性基因PCR检测表明本试验提取出的mtDNA无核DNA和叶绿体DNA的污染,其纯度可满足测序要求。3.线粒体基因组测序结果显示‘21世纪’桃线粒体基因组平均GC含量为59.33%。共测得基因40个。GO功能显著性富集分析表明线粒体基因组中40个基因比对到3类生物功能下的22个亚分组,包括5个分子功能亚分组、7个细胞构成组分亚分组以及10个生物学过程亚分组,其中参与的主要生物功能有细胞进程、代谢过程、结合功能和催化活性。
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