水螅水母(Hydromedusae)是刺胞动物门(Cnidaria)水螅虫纲(Hydrozoa)中经历水母世代的类群,是海洋浮游动物重要的组成部分,在近岸海洋生态系统的物质循环和能量流动中发挥着重要的作用。其结构简单、形态可塑性强,且大多数种类生活史复杂,传统的形态分类和系统学研究面临困难。本研究应用线粒体COI和16S基因片段,开展了中国近海水螅水母类DNA条形码研究,并基于四叶小舌水母线粒体基因组,分析了刺胞动物门系统发育关系。主要结果如下:(1)构建了中国近海常见水螅水母DNA条形码数据库,包括38属65种水螅水母325条COI序列和357条16S序列;其中,23种107条COI序列、16种78条16S序列为首次报道;记录物种形态图片27种135幅;跟踪观察水螅水母生活史6种;(2)探讨了 COI和16S序列在中国近海水螅水母鉴定中的适用性,提出二者均可作为中国近海水螅水母DNA条形码的标准基因片段;(3)发现了厦门美螅水母、嘉庚美螅水母、鼓浪美螅水母、鼓浪高手水母、鼓浪介螅水母和鼓浪镰螅水母六个新种,提出基于DNA条形码与形态鉴定相结合的水螅水母隐种识别和新种发现方法;(4)探讨了矢量分析方法在中国近海水螅水母多样性研究中的应用前景,提出应用该方法评估水螅水母类生物多样性;(5)通过设计一套覆盖四叶小舌水母线粒体基因组全部编码基因的特异性引物,获得了其线粒体基因组序列,该序列为中国首条海洋水母类线粒体基因组序列,也是水螅虫纲硬水母目线粒体基因组的首次报道;(6)分析了四叶小舌水母线粒体基因组结构特征,发现了刺胞动物门线粒体基因组首个tRNA-L基因;(7)基于线粒体基因组分析了刺胞动物门系统发育关系,明确了刺胞动物珊瑚虫纲、十字水母纲、立方水母纲、钵水母纲和水螅虫纲的系统发育地位。