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本试验研究了IBV呼吸型强毒株M41在原代鸡胚肾细胞(CEK)中传代适应过程中，其重要免疫原蛋白基因S1的序列变化规律。将IBV M41鸡胚第六代毒E6在CEK细胞中连续传30代后，然后将M41 E6、CEK F1、F4、F10、F15、F20、F25、F30病毒的S1基因克隆入pMD18-T载体，转化入DH5α大肠杆菌感受态中，随机挑选阳性质粒进行序列测定，并通过DNASTAR及DNASIS软件进行序列比较与分析。试验结果表明：CEK细胞各代适应毒与鸡胚毒E6相比S1基因核苷酸与氨基酸的同源性较高，分别高达99.4％和98.7％以上，且CEK各代次细胞毒之间S1基因的核苷酸与氨基酸的同源性亦较高。S1基因核苷酸与氨基酸的进化树分析可知E6、F1、F4同属一组，亲缘关系较近；而F10、F15、F20、F25和F30同属一组，有较近的亲缘关系。与M41 E6相比，CEK各代适应毒S1基因累计有27个核苷酸的突变，进而导致有16个氨基酸被取代。综观这些突变，几乎在每一代中都有发生，且变化分布在整个S1基因中，没有明显的区域性，大多数变化是随机的没有规律性，只有1020和1465两处核苷酸有渐变过程，即从F10代开始，分别由T取代G，T取代A，相应的在S1蛋白上的340位氨基酸由苯丙氨酸取代亮氨酸，489位氨基酸由酪氨酸取代天冬酰胺。可见CEK细胞适应毒的优势毒是在4-10代之间形成的，且优势毒S1基因在1020，1465两处核苷酸分别为T和G，相应的S1蛋白340，489位氨基酸分别为苯丙氨酸和酪氨酸。