遗传图谱构建是研究番茄性状遗传的重要途径，也是快速获得与目标性状连锁标记的方法之一。本试验研究了番茄SSR技术中PCR体系的主要成分对SSR扩增结果的影响。然后，以性状差异显著的栽培番茄自交系‘XF98-7’(Lycopersicon esculentum Mill.)与野生醋栗番茄(Lycopersiconpimpinellifolium，LA2184)杂交获得了重组自交系群体，应用SSR标记构建了番茄的分子遗传连锁图并定位了几个主要性状。主要结果如下： 1.番茄SSR反应体系的优化 利用番茄材料研究了番茄SSR技术中PCR体系的主要成分对SSR扩增结果的影响，并比较了采用聚丙烯酰胺凝胶和琼脂糖电泳检测扩增产物多态性的差异。结果表明：番茄SSR的反应程序为94℃预变性2min；94℃变性30s，50℃复性30s，68℃延伸30s，循环35周；最后72℃延伸8min时为最佳。反应体系中，模板DNA的适宜浓度为20～40ng，适宜的引物浓度为0.4μmol·L<-1>，dNTP的适宜浓度为200μmol·L<-1>，Mg<2+>的最适浓度范围为2.0mmol·L<-1>，Taq聚合酶在15μl反应体系中宜加入0.65U。PCR产物检测时聚丙烯酰胺凝胶的分辨率显著高于琼脂糖电泳。 2.番茄SSR遗传连锁图谱的构建 以初始花节位低、每序花数少、单果重大和耐盐性较弱的栽培番茄自交系‘XF98-7’与初始花节位高、每序花数多、单果重小和耐盐性较强的野生醋栗番茄杂交获得了重组自交系群体。以获得的146个重组自交系为作图群体，应用SSR标记构建了番茄的遗传连锁图谱。连锁图总长为771.85 cM，包含110个位点，平均图距为7.02 cM，基本满足QTL定位的要求。每条染色体上的标记数为2～19个不等，距离在0.4.～158.2 cM之间，平均间距最大的为第6染色体，为9.45cM，平均间距最小的为第10染色体，为0.2 cM。第1，3，4，6染色体可能由于某一部分的标记不能连锁而被打断，各含有2～3个连锁群。 3.番茄几个产量相关性状的QTL定位 采用软件QTL Cartographer Version 2.5对初始花节位、每序花数、单果重进行数量性状座位(QTL)分析。在第2，11和12染色体上检测到3个与始花节位有关的QTLs，其贡献值分别为15.23％、6.34％和5.54％。其中第2染色体上的QTL贡献率最大，达15.23％。这3个QTLs除了第11染色体上的以外，其余2个QTLs使始花节位提高的等位基因均来源于母本栽培番茄。在第6，10和12染色体上检测到3个与每序花数有关的QTLs，贡献值分别为8.66％、5.80％和 13.11％。这3个QTLs使每序花数增加的等位基因均来源于父本醋栗番茄。在第1，3，10和12染色体上检测到4个与果重有关的QTLs，贡献值分别为8.63％、18.29％、7.91％和9.11％。其中第3染色体上LEat019-LEat020区间的QTL贡献率最大，达18.29％。这4个QTLs除了第12染色体上的以外其余使果重增加的等位基因均来源于母本栽培番茄。 4.番茄幼苗生长期耐盐性状的QTL定位 当选用0.7％，0.8％，0.9％，1.0％和1.1％NaCl 5个浓度对栽培番茄XF98-7和野生醋栗番茄进行筛选时，发现亲本差异最大的盐浓度为1.0％，XF98-7和醋栗番茄的存活率分别为43.75％和75％，因此本试验选用1.0％盐浓度进行RIL群体的耐盐性QTL定位。将调查统计的耐盐数据处理后采用QTLCartographer Version 2.5软件进行耐盐性QTL定位，以LOD>2.0作为确定某一位点存在QTL的阈值。在第1染色体上的SSR201-LEtc001和SSR117-LEtat007区间，第6染色体上的SSR122-SSR116区间，第10染色体上的SSR223-SSR74区间以及第11染色体上SSR109-LEgata002N间共检测出5个QTLs，其贡献率分别为6.39％，9.99％，14.39％，6.95％和9.67％(定名为St.1，St.2，St.3，St.4，St.5)。其中除了St.4使耐盐性增加的等位基因来源于母本XF98-7，其余几个使耐盐性增加的等位基因来源于父本醋栗番茄。