长三角区域地理位置优越，城市密集，经济和社会的发展程度都很高，在全国具有重要战略地位。在经济全球化和区域一体化力量的推动下，长三角区域一体化进程加快，区域政府合作不断深化，区域城市化和区域经济社会发展迅速，成为当代中国经济和社会全面发展的一个核心地区。但如何进一步深化长三角区域发展与区域合作，促进长三角区域更加健康持续发展，需要按照合作治理的要求，通过完善合作机制，提升区域政府合作治理的实效。本文以长三角区域政府合作治理机制作为研究对象，依据政府治理理论和区域合作理论，将长三角区域的政府合作治理机制区分为正式机制和非正式机制、着重探讨三角区域的政府合作治理机制的形成过程及机制内容；采用统计分析方法，选取长三角的地区生产总值、交通运输量、旅游收入和教育合作成果等因素作为衡量区域合作治理机制绩效指标，对长三角区域政府合作的正式机制和非正式机制的治理绩效进行具体分析，认为，长三角区域正式的机制在规范功能、协调功能和解决冲突功能方面的治理绩效较为显著，非正式的机制在推动政府治理和完善政府决策方面的绩效明显。探讨了长三角区域合作机制方面尚存在的问题，认为，正式的机制需要在合作执行机制、利益协调机制和组织运行机制等方面进一步完善；非正式的机制中非政府组织和企业参与区域治理的能力有待进一步提高。对进一步深化长三角政府区域合作提出若干建议。