基于CRISPR-Cpf1的枯草芽孢杆菌基因编辑系统构建及合成透明质酸代谢工程改造应用

来源 :华东理工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:requst2009
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CRISPR技术的快速发展为枯草芽孢杆菌提供了诸多分子生物学工具。因此,建立及拓展枯草芽孢杆菌CRISPR系统具有重要研究意义。透明质酸作为大分子多糖,在医药、食品及化妆品的制各中有着广泛的应用。枯草芽孢杆菌被视为透明质酸生产的优良宿主,研究透明质酸在枯草芽孢杆菌的工业应用能力具有重要研究意义。本课题首先构建了 CRISPR-AsCpf1双质粒系统(pHT01-AsCpf1、pJOE-DRN23DR)用于枯草芽孢杆菌的基因组编辑。其中,包含温敏型复制子reppE194ts的质粒pJOE-DRN23DR可快速高效地消除,优化了基因组编辑流程。应用此系统进行基因组敲除效率、敲入效率及大片段删除效率评估,最高编辑效率分别为:100%、92%、87%。随后,基于CRISPR-AsCpf1系统对枯草芽孢杆菌进行代谢工程改造合成透明质酸。第一,通过引入透明质酸合成途径(hasA敲入)及强化UDP-葡萄糖醛酸合成途径(tuaD敲入)获得菌株B.subtilis-HA03,透明质酸产量为0.96 g/L。第二,胞外多糖基因簇(epsA-O)及关键自溶基因(lytC)的连续敲除优化了底盘菌株,获得菌株B.subtilis HA05,将透明质酸产量提升至1.55 g/L。第三,通过UDP-乙酰氨基葡萄糖合成途径强化、糖酵解及磷酸戊糖途径调控优化透明质酸合成。其中UDP-乙酰氨基葡萄糖合成途径(glmU敲入)强化菌株B.subtilis-HA07进一步将透明质酸产量提升至2.27 g/L。最后,对菌株B.subtilis-HA07进行发酵优化。通过Plackett-Burman试验设计,筛选出对透明质酸生产影响最为显著的因素为蔗糖及酵母粉。最陡爬坡实验进一步优化蔗糖及酵母粉含量将透明质酸产量提升至4.64 g/L。最后优化诱导剂浓度及添加时间将透明质酸产量提升至4.72 g/L,透明质酸分子量为0.54×105 Da。3 L分批发酵HA产量为5.12 g/L。
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