农民专业合作社是通过将农户联结在一起,为了达到降低农业生产成本、提高农户风险抵御能力的目的而成立的互助型合作社组织。《中华人民共和国农民专业合作社法》的颁布和政府的支持为合作社发展提供了良好的外部环境,借此,合作社迅速崛起。随之而来的是多数合作社经营管理出现了问题,其中盈余分配问题尤为严重。盈余分配的公平与否直接影响着合作社的发展壮大。因此,研究农民专业合作社盈余分配的影响因素,在理论上揭示合作社盈余分配的内在规律,在现实中为提高合作社盈余分配水平提供外在依据,具有一定的理论和现实意义。首先,本文对国内外学者关于合作社盈余分配的相关研究成果进行了整理和分析,并在此基础上进行了本文的相关研究。其次,对农民专业合作社的相关概念及理论进行了界定与解释。结合我国农民专业合作社发展及盈余分配整体现状,对合作社盈余分配存在问题进行分析。再次,根据合作社盈余分配影响因素的理论分析中选取的若干影响因子,通过因子分析提取公因子后,采用二元logistics分析方法对各影响因子的显著性进行实证分析。研究结果得出,提取的三个公因子治理结构因素、产权结构因素和自身条件因素对合作社盈余分配都有显著影响。同时,社员代表大会召开次数、理事会成员构成、公开财务状况次数及监事会召开次数决定着合作社组织治理是否完善;股权集中度、理事会成员持股比例、公共积累提取比例及社员交易额决定着产权结构是否规范;合作社服务模式、资本规模与成员文化水平决定着合作社自身条件是否优越。最后,结合存在问题及研究结果提出了健全盈余分配制度、规范产权制度、完善治理结构和提高合作社成员素质水平的建议。