鞘藻目(Oedogoniales)仅鞘藻科(Oedogoniaceae)一科，包括鞘藻属(Oedogonium)，枝鞘藻属(Oedocladium)和毛鞘藻属(Bulbochaete)三个属。在绿藻门中，鞘藻目的种类以其特殊的细胞分裂方式，独具环状排列鞭毛的大型动孢子，复杂多样化的有性生殖特征，使其在整个绿藻纲中自成一个界限分明，而又相当独特的类群。　　 本研究通过对鞘藻目植物进行广泛的采样和分离纯化培养，使用于研究的鞘藻目种类涉及该目所有的三个属，且每个属的种类数达到了两个以上，从而使得对鞘藻目三个属单系性的探讨成为可能。　　 运用多种构树方法对鞘藻目植物18S rDNA序列和28S rDNA序列这两个核基因组中的非编码序列建立了各自的和联合序列的系统发育树，结果显示：鞘藻目为一单系起源的类群；鞘藻目处于绿藻纲中较基部的位置，但其具体的分类地位和与其他绿藻纲植物的亲缘关系尚待进一步研究确定；枝鞘藻属自成一个单系且与鞘藻属无明显分界而毛鞘藻属在鞘藻目的基部处于较另两属较分离的地位；鞘藻属内的几个得到高支持率的分支暗示鞘藻属种类间的亲缘关系可能与它们在性分化特征上的不同有一定的联系。　　 本研究还首次扩增得到了鞘藻目叶绿体基因组中的编码序列——rbcL基因序列。通过对此序列的分析，结合前面两个同样进化速率较慢的核基因组非编码基因的分析结果，本文作者认为，鞘藻目被视为绿藻纲中较独特的一个目更为合适，它处于分化出几类丝状绿藻的较早期的分支上；在鞘藻目中，毛鞘藻属植物较其他两属更为复杂，且和枝鞘藻属一样都可能是由鞘藻属或类鞘藻属型的植物向不同的方向进化而来。　　 最后，本研究通过对鞘藻属ITS2序列的一级结构分析和CBC分析，从分子系统学研究的角度支持了饶钦止先生提出的用植物体在性的分化上的特征作为分类上的首要特征去建立鞘藻属的种类分类系统的说法，并进一步提出了鞘藻属种类间可能存在雌雄同株，雌雄异株具矮雄到雌雄异株具大雄类型的演化关系。