本论文系统研究了内蒙古自治区朱开沟、饮牛沟和辽宁省喇嘛洞三个古代人群的遗传结构。首先,对内蒙古凉城县战国晚期饮牛沟古代人群线粒体DNA进行了分析,结果显示饮牛沟古代人群与现代东亚人群有着较近的亲缘关系。其次,对内蒙古鄂尔多斯东部龙山时代晚期至夏商时期的朱开沟遗址古代人群进行了遗传结构分析,结果表明朱开沟古代人群与其后的内蒙古饮牛沟古代居民及现代东亚人群具有较近亲缘关系,表明从大约4000年前到现在,该地区居民母系遗传上具有一定的连续性。最后,对辽宁省北票市喇嘛洞古代人群进行了遗传结构分析,结果表明喇嘛洞古代人群母系遗传结构非常复杂,与现代东亚人群有着较近的亲缘关系,同时含有西伯利亚人群的成分。喇嘛洞古代人群与匈奴和拓跋鲜卑古代人群具有不同的母系遗传结构。总之,这些结果为推测东北、内蒙古地区古代族群的遗传结构,追溯古代人群与现代人群之间的相互关系,研究该地区历史上各民族的族源、迁徙、分化、融合等历史过程提供了分子遗传学线索。