随着我国高等教育的改革和发展，教育经费投入的增长，促进了高等教育事业的发展。在不断扩大办学规模和提高办学层次的过程中，高校仍然面临经费不足和使用效益较低的问题，经费短缺是制约高校尤其地方高校发展的瓶颈。因此地方高等学校迫切需要建立与发展形势相适应的经费管理体制，规范经济利益的分配，合理配置和有效利用资源，提高资金使用效率，加强经费管理。预算管理是高校经费管理的重要环节，其管理好坏直接影响到学校的财务状况，是关系到高校经济工作全局的重大问题。本文从预算管理的方法等问题着手，研究建立合理的预算编制思路和实施问题，为地方高校的经费管理问题提供科学的决策方法；同时探索建立了一个高校经费使用绩效评价指标体系，运用层次分析法确定各指标的权重，系统地对高校资金使用绩效进行评价，全面促进高校的全面健康的发展。对地方高校A大学进行了实证分析，运用本文的方法对A大学的经费预算，并用本文的绩效评价体系对A大学近三年的经费使用绩效进行评价，证实了本文的研究的可行性与有效性。加强高等学校预算管理，对于学校合理地筹措、分配和使用办学资金，促进高校的发展，具有十分重要的理论意义和现实价值。