【摘 要】
:
目的:1.探讨MRI征象在术前评估较低级别胶质瘤06-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶(06-methylguanine-DNA methyhransferase,MGMT)启动子甲基化状态中的价值。2.探讨Efficient Net-B3卷积神经网络在术前预测MGMT启动子甲基化状态中的价值,并对基于不同序列的所建立模型进行性能比较,选取最佳序列组合进行建模。方法:1.回顾性分析兰州大学第二医院2
论文部分内容阅读
目的:1.探讨MRI征象在术前评估较低级别胶质瘤06-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶(06-methylguanine-DNA methyhransferase,MGMT)启动子甲基化状态中的价值。2.探讨Efficient Net-B3卷积神经网络在术前预测MGMT启动子甲基化状态中的价值,并对基于不同序列的所建立模型进行性能比较,选取最佳序列组合进行建模。方法:1.回顾性分析兰州大学第二医院2016年6月-2020年6月经手术病理及分子病理证实的89例较低级别胶质瘤患者的临床及影像学资料,其中MGMT启动子甲基化共59例,非甲基化共30例。所有患者术前均行MRI扫描,包括T1WI、T2WI、FLAIR、DWI及T1WI增强序列。对肿瘤的发病性别、年龄、位置、病变数目、肿瘤直径、囊变坏死、肿瘤边界、出血、瘤周水肿、是否跨越中线、强化程度等征象及ADCmin值、ADCmean值、n ADC值进行统计学分析,通过受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线对MGMT启动子甲基化状态相关指标效能进行评价。2.将收集的121例较低级别胶质瘤的MRI图像的T2WI及T1增强序列,通过手动选取每个患者所有包含病灶层面的图像,按照7:3随机分成训练集(n=85)及验证集(n=36),应用Efficient Net-B3卷积神经网络构建了独立的基于T2WI、T1WI增强、T2WI联合T1WI增强的预测模型T2-net、T1C-net、TS-net,通过ROC曲线对各个模型预测效能分别进行评价。结果:1.与MGMT非甲基化组相比,较低级别胶质瘤MGMT甲基化组的ADCmin值[(0.97±0.30)×10-3vs(0.84±0.23)×10-3 mm2/s]显著更高,差异具有统计学意义(P=0.032)。而MGMT甲基化组与非甲基化组ADCmean值[(1.10±0.32)×10-3 vs(0.99±0.32)×10-3 mm2/s]及n ADC值[(1.48±0.46)vs(1.37±0.44)]差异不具有统计学意义(P均>0.05)。利用ADCmin值将较低级别胶质瘤MGMT甲基化组与非甲基化组进行鉴别时,AUC值为0.646,当ADCmin=0.76×10-3 mm2/s时,敏感度为76%,特异度为57%。而两组间的发病年龄、性别、肿瘤的位置、病变数目、是否跨越中线、是否出血、肿瘤边界、囊变有无、肿瘤直径、囊变最大径、水肿最大径、强化程度差异均无统计学意义(P>0.05);2.T2-net模型在在验证集上准确率为72.3%,敏感度为64.7%,特异度为73.3%,ROC曲线下面积(AUC)为0.718;T1C-net模型在验证集上准确率为66.8%,敏感度为68.3%,特异度为66.9%,ROC曲线下面积(AUC)为0.721;TS-net模型在验证集上准确率为81.8%,敏感度为63.1%,特异度为85.0%,ROC曲线下面积(AUC)为0.784。结论:1.ADCmin值在术前评估较低级别胶质瘤MGMT甲基化状态具有初步的参考价值;利用常规MRI征象不能对较低级别胶质瘤MGMT甲基化状态进行评估。2.基于MRI的Efficient Net-B3卷积神经网络可以预测较低级别胶质瘤MGMT启动子甲基化状态,基于T2WI联合T1WI增强的TS-net模型预测性能最佳,模型对术前无创性预测MGMT启动子甲基化状态具有价值。
其他文献
目的:本文主要研究M2型丙酮酸激酶(pyruvate kinase M2,PKM2)和Notch1在人结直肠癌组织标本及体外培养的结直肠癌细胞系RKO和HT29中的表达及其临床意义,以期为结直肠癌的靶向治疗提供新的研究思路。方法:1.收集66例经我院病理活检诊断为结直肠癌的手术标本,通过免疫组化法检测所收集手术标本中PKM2和Notch1在蛋白水平的表达,并分析两者表达水平之间的相关性,以及两者的
目的:通过16S rRNA高通量测序分析胆管癌与胆总管结石患者胆道菌群构成及差异。方法:前瞻性纳入胆管癌和胆总管结石患者,收集患者的临床资料,于ERCP及外科手术中收集患者胆总管胆汁样本,进行DNA提取和16S rRNA测序,分析胆管癌患者与胆总管结石患者胆道菌群构成及差异。结果:本研究最终纳入胆管癌患者15例(肿瘤组)以及胆总管结石患者20例(对照组)。所有样本细菌检出率均为100%,胆管癌患者
研究目的 胰腺癌是临床常见的恶性肿瘤之一。因其早期及部分中期患者未见特异性临床症状,往往发现时已成晚期,难以手术治疗,同时,其化学治疗的疗效常常不佳,故病死率较高。REG基因是Ca2+依赖性凝集素基因家族成员,其编码的蛋白属于小分泌蛋白。REG蛋白在炎症时分泌增多,具有调节细胞生长和凋亡的能力,与各种恶性肿瘤的关系密切。其中,REG3G蛋白具有调控细胞凋亡,调节肿瘤内环境,平衡机体肠道菌群的能力,
目的:本研究旨在利用机器学习相关原理对膀胱癌的免疫分子亚型及免疫逃逸的潜在分子机制进行研究,并探索亚型与免疫相关特征的相互联系。方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genomic Atlas,TCGA)数据库中下载膀胱癌转录组数据及单核苷酸变异(simple nucleotide variation,SNV)数据,样本包括412个肿瘤及19个癌旁组织,数据提取和后续分析均使用R 4.0.
目的:研究纤溶酶原激活物抑制剂1(Plasminogen activator inhibitor 1,PAI1)是否通过失巢凋亡抵抗来影响胃癌的侵袭及转移能力,进一步探讨PAI1是否通过能量代谢途径调控胃癌失巢凋亡抵抗。方法:(1)通过生物信息学方法预测PAI1在胃癌中的表达水平,并预测其在胃癌患者中的预后价值;(2)通过免疫组织化学染色半定量的方法检测胃癌组织、癌旁组织和淋巴结中PAI1的表达水
背景与目的:胆管癌(cholangiocarcinoma,CCA)是一组高度异质性的胆道恶性肿瘤,可发生于胆道系统的任何部位,近年来CCA的发病率在全球范围内呈增长趋势。由于疾病早期缺乏典型的临床症状和临床指标,大多数CCA患者在明确诊断时已经失去最佳手术时机。因此,探究胆管癌发生发展过程中的分子生物学机制,筛选和验证胆管癌新的诊断及预后标记物具有重要意义。近年来发现竞争性内源RNA(compet
目的:采用系统评价的方法定量评估上皮细胞黏附分子(EpCAM)在结直肠癌组织中的表达差异与临床病理特征之间的相关性,并评估EpCAM在结直肠癌方面的诊断准确性。方法:利用计算机检索中文在线数据库(维普数据库、万方、中国知网)。检索英文在线数据库(Web of Science、Embase、Pub Med、Cochrane Library)。检索完成后,将文献分类导入Endnote X9,并按照文献
目的:研究C-反应蛋白/白蛋白(C-reactive Protein/Albumin,CRP/Alb)比值(CAR)对腹腔镜结直肠癌根治术后并发症预测作用,并分析影响术后并发症的危险因素。方法:回顾性收集2017年1月至2020年2月在兰州大学第二医院普外科行腹腔镜结直肠癌根治术患者的临床资料。首先,根据患者是否发生并发症将其分为并发症组和非并发症组,分析术后第1天、第3天、第5天的CAR值与CR
研究背景:三阴型乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)属于一类高度异质性的乳腺恶性肿瘤。由于它们缺少了雌激素受体(estrogen receptor,ER)、孕激素受体(progesterone receptor,PR)及其人表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor,HER2),所以目前针对TNBC的治
背景及目的:胆管癌是一种起源于胆道上皮细胞且侵袭性极强的常见胆道恶性肿瘤。由于早期临床症状不明显导致诊断困难,所以胆管癌病人预后并不理想。近几十年来,胆管癌的许多生物标志物被广泛应用,但由于均存在其自身限制,这些生物标志物仍不足以充分了解胆管癌的机制,优化治疗策略。我们需要更有效的方法筛选出更有临床价值的生物标志物。本研究的目的是通过生物信息学分析探寻与胆管癌患者预后相关的差异表达基因(diffe