深化改革是加快转变经济发展方式的关键,处理好政府和市场的关系是改革的核心问题。这一过程中要逐步使市场在资源配置中起决定性作用,更好地发挥政府职能,因此社会运行机制中将会出现大量新的空白地带。而随着社会转型的逐步推进,社会中介组织正以前所未有的发展速度在越来越多的领域中发挥重要作用。建立“政府—社会中介组织—市场”这样一个三元架构也将成为理顺政府与市场关系的必然选择。深层变革中,社会中介组织应具有明显的自治性、法治性、服务性和自律性,并通过这些特征的价值发挥弥补政府与市场的双重失灵。然而现阶段社会中介组织的发展却面临着诸多困境,自治性与法治性的不足、服务性与自律性的欠佳导致其不能很好地在政府与市场间发挥纽带作用。阻碍其发展的因素源于政府、市场、社会和文化等多方面,其中政府部门职能定位偏误成为主要影响力量。因此必须围绕深层变革中社会中介组织应有的四大特征,采取针对性措施优化其发展的内外环境,使其成为政府职能转移的承接者、市场价值发挥的推动者、社会管理创新的参与者,从而更好地使市场在资源配置中发挥基础性作用,推进政府职能转型,最终实现政府与市场关系的深层变革。