MiR-200b-3p对鸡抗原递呈通路的影响

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MicroRNA是一类非编码单链RNA分子,长度约为22个核苷酸,普遍存在于真核生物体内,参与多种生命过程的调控。miRNA在鸡的生长、发育、代谢等生理过程中发挥着非常广泛的基因调控功能,对病毒感染、细胞凋亡、单核细胞/巨噬细胞分化和免疫细胞的发育及功能等过程也有重要的调控作用。本研究对未免疫组和免疫组SPF鸡的脾脏和法氏囊进行small RNA-seq,通过分析筛选出与抗原递呈相关的miRNA,并以miR-200b-3p作为研究鸡抗原递呈的候选miRNA,一方面研究miR-200b-3p对抗原递呈的影响,另一方面研究miR-200b-3p及其靶基因对抗原递呈的分子机制。论文主要结果如下:1.small RNA-seq结果表明:法氏囊和脾脏在免疫前后分别有36和43个miRNA表达量存在显著差异(P<0.05)。GO功能分析表明:候选miRNAs的潜在靶基因主要富集在蛋白质结合、转录因子结合、代谢过程、T细胞活化、免疫系统过程、免疫突触等过程。KEGG通路分析表明:候选miRNAs的潜在靶基因主要富集在卵母细胞减数分裂、mTOR信号通路、TGF-β信号通路、细胞周期等通路。结合以上分析,推测miR-200b-3p及其靶基因MMD和DUSP1可能参与了抗原递呈过程。2.qRT-PCR检测过表达和干扰miR-200b-3p的HD11细胞中抗原递呈相关基因的表达情况,结果表明,miR-200b-3p能够促进HD11细胞中CD86、CD80等抗原递呈相关基因的表达。流式细胞术检测过表达和干扰miR-200b-3p的HD11细胞表明MHC-II的表达情况,结果表明,miR-200b-3p能够促进HD11细胞表面MHC-II的表达。3.利用TargetScan和miRDB对gga-miR-200b-3p进行靶基因预测,结合实验室前期研究和文献报道,选择DUSP1和MMD作为候选靶基因,通过双荧光素酶报告实验和qRT-PCR确定gga-miR-200b-3p能够靶向抑制DUSP1和MMD的表达。4.在HD11细胞中,过表达MMD能够抑制IL6、MHC-II等抗原递呈相关基因的表达。
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