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银杏（Ginkgo biloba L. ）属银杏科银杏属,为中生代第四纪冰川期的孓遗植物,有“活化石”之称。我国是银杏的原产地,许多地方有规模不等的银杏古树,湖北随州就是我国主要的银杏古树集中分布区之一。本研究采集随州121株古银杏的叶片样品和30株古银杏的种子样品为研究样本,利用RAPD和ISSR分子标记技术,从群体和个体2个层次,对随州古银杏的遗传多样性进行了分析研究。主要结果如下: （1） 用9条RAPD引物和9条ISSR引物分别对随州大洪山区7个群体共121株古银杏的叶片DNA进行扩增,分别得到104条和107条清晰的扩增谱带,其中多态性带分别为103条和105条,多态性条带百分率（PPB）分别为99.04%和98.13%。RAPD所揭示的古银杏遗传多样性无论是物种水平（HE=0.3241,HO=0.4887）还是群体水平（HE=0.2302,HO=0.3440）均与ISSR分析所得的结果（物种水平:HE=0.2516,HO=0.3913;群体水平:HE=0.1775,HO=0.2697）相近。由RAPD所得的遗传一致度和由ISSR所得的遗传一致度之间的相关系数r=0.6932>r0.01（P=99.65%）,两者的相关性达到极显著水平。 （2） 依据RAPD和ISSR实验数据,对古银杏群体进行Nei’s遗传多样性分析和AMOVA分析,揭示出随州古银杏群体间遗传分化水平。RAPD结果揭示出大洪山区7个群体的GST=0.2896,φST=24.22%;ISSR结果揭示出这7个群体的GST=0.2944,φST=23.12%。将桐柏山区的草店群体考虑在内,则遗传分化值更高,GST=0.3380,φST=32.05%。 （3） 分别依据古银杏叶片样品的RAPD和ISSR标记数据,进行了群体和单株聚类分析。8个群体共129个单株的UPGMA聚类分析显示,来自同一群体的个体基本上都能各自聚在一起,表明各银杏群体间已有相当程度的遗传分化,特别是草店群体,与其它7个群体之间的分化程度最高,表现出明显的地区性差异,而群体聚类结果并没有表现出地域差异。群体间一定程度的遗传分化可能是人类生产活动和基因流障碍引起的。 （4） 从选出的9条ISSR引物中,再次挑选6条扩增谱带较多的ISSR引物,对30株古银杏的150粒种子的胚乳DNA进行ISSR分析,以分析随州古银杏在个体水平上的遗传多样性。共扩增出91条ISSR谱带,从单倍体水平和二倍体水平统计的多态性条带分别为90条和64条,多态性条带百分率分别为98.90%和70.33%。检测出的平均杂合位点有39个,平均杂合率为43.53%,杂合率最高的古银杏个体达到54.95%,最低的也有34.07%,显示出该地银杏古树的杂合程度都比较高。古银杏在个体水平的平均遗传多样性为HE=0.1617、HO=0.2393。古银杏单株间的遗