遗传性心脏传导阻滞家系全外显子测序研究

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背景:多种疾病可以引起心脏传导阻滞,遗传性心脏传导阻滞较为少见。既往多采用一代测序,如Sanger测序,寻找致病变异。已报道的心脏传导阻滞相关基因有近20个,包括KCNJ2,HCN4,NKX2-5,LMNA,TRPM4等。全外显子测序是利用序列捕获技术,是将全基因组外显子区域的DNA捕捉并富集后进行高通量测序的第二代测序技术。与传统的一代测序方法相比,全外显子测序具有耗时短、成本低、对样本需求量少等特点。本文通过对一个遗传性心脏传导阻滞家系进行全外显子测序的方式,找出其可能的遗传性致病基因。目的:寻找遗传性心脏传导阻滞家系的致病基因。方法:通过询问病史和心电图检查,对一个含有3名患者的家系进行筛查,采集家系中3名患者和3名正常成员的外周血,提取淋巴细胞,抽提gDNA,对这6名家庭成员的gDNA进行全外显子测序,筛选出患者特有的疑似变异,对疑似变异基因使用在线DAVID进行分析,接着运用SIFT、PolyPhen.score以及caseMutationFrq对疑似变异进行筛选,与传导阻滞发生的机制相结合,筛选出致病变异,在Pubmed上进行查重,并使用Sanger测序验证该变异。结果:该包含3名心脏传导阻滞患者的家系呈常染色体显性遗传特点。患者共有而正常对照组无的变异共186个,包含162个基因。经过SIFT、Polyphen.score及case MutationFrq筛选后剩下18个基因,结合心脏传导阻滞相关基因,得到SCN5A G3416A(R1139Q)和KCNJ12 A1289G(E430G)两个变异。经Sanger测序,KCNJ12c.A1289G/p.E430G不存在,SCN5A G3416A(R1139Q)存在。既往无SCN5A R1139Q与心脏传导阻滞有关的报道。结论:该包含3名心脏传导阻滞患者的家系呈常染色体显型遗传,SCN5A中的R1139Q基因变异为此家系中3名患者特有。我们首次发现遗传性心脏传导阻滞与SCN5A的杂合变异R1139Q有关。
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