帕金森病GAK/DGK-θ基因型与临床表型研究

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背景散发性帕金森病(sPD)是一种慢性神经退行性疾病,主要影响老年人群。随着人口老龄化的迅速增加,中国的sPD数量逐渐增加。目前,sPD的公认风险因素包括遗传和环境因素。全基因组关联分析显示在染色体4p16.3区GAK/DGK-θ/IDUA区域是帕金森病(PD)三大风险位点之一,但具体的基因和风险机制尚不清楚。目前尚无关于豫北地区人群中GAK/TMEM175/DGK-θ基因SNP多态性包括碱基的置换、颠换、缺失和插入与sPD的风险相关的报道。因此,针对中国散发性帕金森病患者GAK/TMEM175/DGK-θ区域SNP位点进行检测并对其临床表型进行分析,为临床散发性帕金森病的诊断奠定基础。目的建立人全血基因文库,对散发性PD患者中GAK/TMEM175/DGK-θ基因SNP位点进行检测,探讨豫北地区散发性PD患者与SNP多态性及临床表现之间的关联,为帕金森病的诊断奠定基础。方法收集2017年10月至2019年2月就诊于新乡医学院第一附属医院神经内科具有运动障碍、帕金森样症状的病例。抽取外周静脉血,提取基因组,设计对应SNP位点引物,PCR扩增法获得目的片段并进行测序,进行结果比对分析。同时收集患者临床资料,包括人口学基本信息、运动症状量表评分及非运动症状量表评分,运用统计学软件进行分析整理。此外,收集体检科健康人全血,对相应SNP位点进行基因扩增和测序,作为对照分析。结果本研究共纳入50例PD患者,50例健康人作为对照。(1)对GAK基因的rs11248051、rs1564282位点进行分析,结果显示:rs11248051野生型基因型为G/G,在PD患者中共检测到6例突变,4例为杂合性突变,基因型为A/G,2例纯合性突变,基因型为A/A,健康人中检测到4例杂合性突变基因型为A/G,二组(PD组和健康组)无统计学差异(P=0.505)。此外,在rs1564282位点,野生基因型为G/G,PD病人和健康人中均检测到1例纯合型突变A/A,二组无统计学意义(P=1)。(2)对TMEM175的rs6599388、rs142821586、rs6599389、rs34311866位点进行分析,结果显示:rs6599388位点野生基因型为C/C,PD患者中检测到35例突变,6例为纯合型突变G/G,29例为杂合性突变C/T,在健康人中发现有27例突变,其中10例为纯合型突变T/T,17例杂合型突变C/T,二组无统计学意义(P=0.099)。rs142821586野生基因型为C/C,在PD患者中检测到4例发生突变,基因型为A/C,在健康人中发现2例此类突变,二组无统计学意义(P=0.678)。此外,在该SNP位点检测到TC碱基的缺失,基因型为TC/-,PD患者中共发现12例,在对照组中发现13例,无统计学意义(P=0.817)。rs6599389位点野生基因型为G/G,在PD患者中检测到16例发生突变,其中10例为A/G,6例为A/A,健康人中发现7例突变,基因型为A/G,两组有统计学意义(P=0.032)。rs34311866位点野生基因型为T/T,在PD患者中检测到6例发生突变,3例为C/C,3例为C/T,在健康人中发现5例突变,基因型为C/T,二组无统计学差异(P=0.749)。(3)对于DGK-θ基因rs11248060进行分析,结果显示:其野生基因型为G/G,在PD病人中共检测到13例基因突变,其中11例为A/G,2例为A/A,健康人中检测到4例突变,基因型为A/G,两组有统计学差异(P=0.017)。(4)对于TMEM175基因,在病人组和健康人组均发现了新的基因片段的出现,在病人组和健康人组分别发现了3例。(5)将rs11248060纳入Logistic线性回归模型,β=1.384,OR=1.384,P=0.026,P<0.05,95%CI(0.074-0.846),说明rs11248060基因多态性可能是PD的风险因素。(6)TMEM175rs6599389的多态性与帕金森病患者震颤症状具有相关性,β=1.601,P=0.015,OR=4.959,95%CI(1.364-18.034),P<0.05,说明rs6599389的突变可能是震颤发生的高风险因素。结论1.GAK rs11248051、GAKrs1564282的多态性可能和豫北地区汉族人群散发性帕金森病关联性不大。2.TMEM175 rs6599389可能与豫北地区汉族人群散发性帕金森病具有相关性,并且rs6599389的突变可能是震颤发生的高风险因素。TMEM175 rs6599388、rs142821586、rs34311866以上SNP的多态性可能和豫北地区汉族人群散发性帕金森病关联性不大。3.在TMEM175基因发现的新的基因片段“TG AG GC AG CC TG TC AT GG CA GT CC CAT”,其意义仍有待探讨。4.DGK-θrs11248060可能与豫北地区汉族人群散发性帕金森病具有相关性。
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