Xcc 8004中两个编码假定蛋白的基因功能的鉴定

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十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pv.campestris,简称Xcc)是一种在全世界范围内能够引起十字花科植物黑腐病的革兰氏阴性菌,又称为甘蓝黑腐病菌,主要侵染甘蓝、油菜、白菜、荠菜、萝卜等农作物,给农业经济造成巨大的损失。在本实验室的前期研究工作中,筛选到一批可能与Xcc8004菌株的致病性、胞外多糖(EPS)合成有关的基因,为了进一步明确这些基因的功能,本研究采用自杀质粒pK18mobSacB和pK18mob介导的方法,分别通过同源双交换和同源单交换构建了两个编号为XC1348、XC3744基因的缺失突变体和非极性整合突变体,并分析比较突变体的表型。根据Xcc 8004菌株基因组的注释,XC1348编码一个假定蛋白。根据缺失突变体和非极性整合突变体的表型分析,XC1348基因的突变不影响胞外多糖产量、胞外酶的活性,也不影响细菌的运动性和基本生长,并能在非寄主植物上引起过敏反应。但缺失突变体与整合突变体对寄主萝卜的致病力有所不同,缺失突变体的致病力与野生型几乎相当,整合突变体的致病力下降明显。构建整合突变体的互补菌株CNK1348并对其致病性进行检测,CNK1348的致病力不能恢复至野生型的水平,表明XC1348与致病性无关。利用半定量RT-PCR的方法分析由XC1348、XC1347、XC1346、XC1345构成的假定基因簇在转录水平表达上存在何种关系,初步确定XC1348能够负调控下游三个基因,同时凝胶阻滞实验证明了XC 1348编码的蛋白是一个转录因子。根据Xcc 8004基因组的注释,XC3744编码一个假定蛋白,该基因的缺失突变体致病力显著降低,构建的互补菌株CDM3744其致病力能恢复至野生型90%的水平,表明XC3744与致病性相关。突变体抵抗蛋白质变性剂的能力有所降低,但不影响胞外多糖产量、胞外酶活性及细菌运动性,5’RACE实验初步确定了 XC3744的转录起始位点位于起始密码子上游55 bp处。
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