当前我国经济进入到由高速增长向高质量增长模式转换的进程,通过实施创新驱动发展战略的方式来提升经济发展的质量水平已成为实现经济增长方式转变的有效途径。本文利用2014-2017年19个省级行政单位的面板数据,首先对于政府引导基金的引导效应进行验证,结果表明,引导基金设立的目标规模与引导基金参与投资额之间呈现显著的正向关系,其设立能够吸引并带动社会资本的投资;但是引导基金存在较为严重的资金结存现象,引导撬动社会资金投资的成效尚未得到有效发挥。随后采用因子分析法构建省域吸收能力综合得分,对2014-2017年各省级行政单位研发主体所处外部环境进行多维度综合评价,并将此得分作为门槛变量引入面板门槛模型,进一步分析政府直接的R&D资金投入以及引导基金参与的投资额与创新产出之间的关系及其所具有的门槛特征。本文研究发现:政府直接拨付研发经费以及设立引导基金对于创新产出均存在显著正向影响且存在门槛效应,其促进作用随着地区吸收能力综合得分的变化分别呈现先减弱后增强的正U型特征及先明显增强后减弱的倒U型特征,即在科技创新环境条件相对落后地区及科技创新环境条件完善发达地区,相较于设立引导基金模式,政府直接资金对于创新产出表现出更为明显的促进作用;当科技创新环境条件位于中部区间时,政府引导基金对于创新产出的作用效果明显高于研发资金拨付。最后,结合实证研究结果,为政府出台更有针对性的R&D扶持政策提出了相关建议,为提高政府研发活动支持措施的有效性提供参考。