基于转录组学和代谢组学分析小麦冷反应特征

来源 :河北农业大学 | 被引量 : 21次 | 上传用户:skljgsdklj
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
低温是影响小麦生长发育及产量的非生物胁迫之一,因此从分子生物学角度揭示小麦耐低温遗传机制十分必要。本研究选用京411为材料,利用RNA-seq和广泛靶向代谢组技术,研究京411小麦幼苗经过4℃低温驯化处理28天和-5℃冷冻处理24h后,茎基部基因表达谱和代谢谱变化。主要研究结果如下:1.利用广泛靶向代谢组学技术,研究京411小麦幼苗茎基部经过4℃低温驯化28天和-5℃冷冻处理24h后代谢谱变化。结果显示:经过4℃低温驯化处理28天幼苗(LTA)与20℃正常培养28天幼苗(NTG)相比,共有86个代谢物上调、137个下调。差异代谢物主要包括糖类、黄酮类、有机酸和植物激素等,其中多种糖类发生明显变化,如:棉子糖、海藻糖、果糖和甘露糖等,且棉子糖增加129.44倍;共筛选出25种氨基酸类差异代谢物,其中脯氨酸增加11.81倍。差异代谢物主要参与“精氨酸和脯氨酸代谢”、“半乳糖代谢”和“植物次级代谢物合成”等代谢通路;对LTA和NTG幼苗分别进行-5℃冷冻处理24h后,找到8个共有差异代谢物,包括脱落酸和茉莉酸-异亮氨酸等。并发现外源喷洒ABA能够提高小麦幼苗抗寒性,但抗寒性不同的品种间最适浓度不同。2.利用RNA-seq技术,研究京411小麦幼苗茎基部受到4℃低温驯化28天和-5℃冷冻处理24h后基因表达谱变化,结果显示:冷驯化处理28天后,小麦幼苗茎基部在转录水平上有29066个基因表达量发生变化,其中|log2FoldChange|>7的差异基因有108。差异基因主要参与合成冷相关蛋白、叶绿素a/b结合蛋白、信号转导蛋白和转录因子等;在LTA vs LTAF和NTG vs NTGF两组差异基因比较中,发现多个与转录因子、钙信号转导和冷诱导蛋白相关的共有差异基因。差异基因主要参与代谢通路、植物激素信号转导、淀粉和糖代谢和次级代谢物合成等代谢途径。3.转录组与代谢组联合分析解析小麦冷胁迫反应特征。对经过4℃低温驯化28天后小麦幼苗(LTA)与正常培养28天(NTG)进行差异代谢物和差异基因联合分析,发现在多条代谢通路中差异基因变化趋势和下游代谢物含量变化趋势基本一致。其中在“精氨酸与脯氨酸”通路中,脯氨酸含量发生明显增加,P5CR和P5CS基因表达量增加,且ProDH表达量降低,说明脯氨酸在冷胁迫响应中发挥重要作用。综上所述,本研究共检测到多种响应低温的差异代谢物和差异基因,显著富集脯氨酸合成、糖类合成、脱落酸信号通路和茉莉酸信号通路中,为阐述小麦抗寒分子机制提供了理论基础。
其他文献
文章首先论述了分层教学的必要性,然后阐述了分层教学的实施,包括课前要根据学生情况进行分层,重视教师备课;课中做好教学过程分层,配合课堂练习分层;课后强化辅导分层,关注
个人客户信息是银行业务积累的一项重要基础数据,更是客户个人隐私权益保护的重要内容,任何客户信息泄露、倒卖行为都会直接损害客户权益,给银行造成严重的声誉及合规风险。
传统经济理论对节约的理解存在缺陷。节约人类在促进社会进步活动中,对稀缺性资源的合理使用,人的需求的无限性与资源有限性的矛盾,人生的目的和追求以及人类社会的发展过程决定
随着技术的日益成熟,欠平衡钻井领域已经形成一个完整的产业链。不过,欠平衡钻井在我国还属于新技术,尚未得到广泛应用。在某些技术引进项目中,国外专利权人对单口钻井的知识
组织之间的兼容性成为影响跨国并购知识转移的重要因素。技术兼容性和惯例兼容性是组织兼容性的重要构成要素。技术兼容性体现为并购双方知识的相似程度,而惯例兼容性表现为
南方航空公司是我国知名航空公司,其运营状况一直受到广泛关注。本文在宏观行业分析的基础上,结合公司基本面情况,利用股息贴现模型和市盈率估值法结合进行计算,旨在得到较为
中国加入世界贸易组织,使企业在更高的层面参与国际竞争.企业在饱尝与跨国巨头竞争艰辛的同时,也深切的感受到在残酷的市场环境中,唯有"苦练内功",着力提高企业的核心竞争力,
纤维增强复合材料(Fiber Reinforced Polymer简称FRP)筋具有抗拉强度高、耐久性能好、质量轻、抗疲劳性能好、耐腐蚀等优点,已作为配筋材料应用于混凝土结构中。工程用水泥基
针对政务云环境下数据共享面临的平台层、数据层和业务层三个层次的安全风险,提出数据共享安全模型,深入分析数据提供方、使用方、平台服务方和共享监管方四个共享主体的安全
通过对1954年洪水资料的统计整理,采用水文模型模拟,分析了1954年和1998年的洪水。结果表明:通江湖泊的围垦对1998年城陵矶洪水的水位抬升了0.82m,洞庭湖围垦则抬高了0.14m。若恢复