【摘 要】
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目的:肝细胞癌（HCC）是一种具有高度恶性、复发性和耐药性的肿瘤,肝细胞内基因表达异常与HCC的发生密切相关,本研究的目的是筛选肝脏肿瘤组织和正常肝脏组织之间的差异表达基因（Differentially expressed genes,DEGs）并寻找枢纽基因,为肝癌的诊断及治疗提供相关潜在靶点。方法:从高通量基因表达数据库（Gene Expression Omnibus,GEO）中分别下载基因表
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目的:肝细胞癌（HCC）是一种具有高度恶性、复发性和耐药性的肿瘤,肝细胞内基因表达异常与HCC的发生密切相关,本研究的目的是筛选肝脏肿瘤组织和正常肝脏组织之间的差异表达基因（Differentially expressed genes,DEGs）并寻找枢纽基因,为肝癌的诊断及治疗提供相关潜在靶点。方法:从高通量基因表达数据库（Gene Expression Omnibus,GEO）中分别下载基因表达谱数据（GSE62232、GSE89377和GSE112790）,运用在线工具GEO2R对数据进行分析并筛选差异表达基因。使用基因本体论（gene ontology,GO）功能和京都基因和基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）通路富集分析对DEGs进行注释。通过Cytoscape软件可视化构建蛋白质与蛋白质互作网络（PPI）并从中筛选核心网络。使用在线绘图生存分析工具Kaplan-Meier来评估差异表达基因的预后表现,人类蛋白质图谱（Human Protein Atlas,HPA）用于展示核心基因的蛋白质水平表达差异。结果:共鉴定出50个表达上调的DEGs和122个表达下调的DEGs,筛选出10个具有高度连接度的枢纽基因,分别是CCNB2、CDC20、AURKA、TOP2A、MELK、NCAPG、KIF20A、UBE2C、PRC1和ASPM,Kaplan-Meier生存分析显示这些差异基因的过表达均与HCC的总生存期及无复发生存期相关。结论:GO和KEGG分析结果发现差异基因主要富集于氧化还原（oxidation reduction）、细胞外区域部分（extracellular region part）、电子载体活性（electron carrier activity）、细胞周期（cell cycle）,这些因素可能密切参与肝细胞癌的发生、发展过程。相对于正常肝脏组织,CCNB2、CDC20、AURKA、TOP2A、MELK、NCAPG、KIF20A、UBE2C、PRC1和ASPM在肝脏肿瘤组织中高表达且与患者生存期相关,它们可能是肝癌诊断及治疗的重要潜在靶点。
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