肾乳头状细胞癌焦亡相关基因预后风险模型的构建

来源 :重庆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:whk213071596
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细胞焦亡被定义为一种以成孔效应蛋白介导的炎性程序性细胞死亡方式。研究发现,细胞焦亡与肿瘤的发生、侵袭及预后有关。肾乳头状细胞癌(KIRP)是一种泌尿系统常见的肿瘤,文献提示可能与细胞焦亡存在一定的关联,但具体作用不清楚。研究中,我们利用生物信息的方法针对52个与焦亡相关基因(PRGs)在28个正常肾脏组织和249个KIRP组织中的表达情况进行了综合分析,发现20个差异表达基因。进一步进行一致性聚类分析,显示患者人群可分为在生存时间上有显著差异(p=0.0041)的两个亚簇。随后,我们采用单因素Cox回归和LASSO-Cox回归分析建立了包含6个PRGs(CASP8、CASP9、CHMP2A、GPX4、IL-6和IRF1)的预后风险模型,其对患者1年、3年和5年的总生存期能做出良好的预测。Kaplan-Meier生存曲线分析表明,与低危组相比,高危组的死亡风险明显较高,生存时间较短(P<0.001);此外,风险评分(RS)是KIRP患者生存的独立危险因素(HR:2.655,95%CI:1.192-5.911,P=0.016)。进一步的免疫分析高危组和低危组之间的免疫细胞浸润水平也存在显著差异,表明肿瘤微环境的免疫状态可能在KIRP进展中发挥了重要作用。完成模型的构建和分析后,我们确定了2个枢纽基因(IL-6和CASP9),并通过免疫组化实验进行验证。综上所述,我们通过综合分析KIRP的PRGs表达,构建了焦亡相关的预后风险模型,并通过检测2个枢纽基因在临床标本中的表达获得了一定程度的验证。本研究为KIRP的预后判读及寻找新的靶点提供了新的思路。
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