KDSR调控鞘脂代谢与未折叠蛋白反应参与白血病发生发展的研究

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ttgxa
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【目的】CRISPR/Cas9文库筛选技术有助于发现参与不同疾病的重要基因和治疗靶点。前期文库筛选发现KDSR基因对白血病细胞的生存至关重要,但有关KDSR在白血病中的作用尚未见报道,且机制不明。本课题拟验证KDSR在白血病中的重要作用,探讨其参与白血病发生发展的可能机制。【方法】1、应用CRISPR/Cas9文库筛选技术在MOLM13和MV4-11细胞中鉴定参与白血病细胞生存的重要鞘脂酶;2、通过在8种不同癌症细胞中进行生存竞争实验验证鞘脂酶KDSR在白血病中的重要性;3、通过流式细胞仪检测MOLM13和MV4-11中敲除KDSR基因后细胞凋亡及周期,细胞染色及电镜检测细胞的分化及内质网变化;4、应用质谱分析检测KDSR敲除后主要鞘脂改变情况;5、RNA-seq分析KDSR影响白血病细胞的可能信号通路,并通过蛋白印迹法(Western blot,WB)进行验证;6、通过透射电子显微镜检测KDSR敲除后,增加鞘脂或内质网应激药物处理后细胞内质网的形态变化;7、通过流式细胞仪检测检测在不同癌症细胞汇总增加相应鞘脂或内质网应激药物处理后对细胞生存率的改变情况;8、通过流式细胞仪检测不同癌症细胞在敲除KDSR基因,增加鞘脂,以及内质网应激相关药物治疗后细胞的生存比率,分析其在白血病细胞与其他癌症细胞中的差异;9、应用流式细胞仪检测不同癌症细胞中内质网应激药物与KDS双处理后白血病细胞与其他癌症细胞的生存差异。【结果】1、在白血病细胞株MOLM13和MV4-11细胞中,通过对29个鞘脂酶基因进行CRISPR/Cas9文库筛选发现KDSR基因对白血病细胞生存最重要,生存竞争实验验证了敲除KDSR后白血病细胞MOLM13,MV4-11,Jurkat和Hut78细胞活性明显降低,而其他细胞293T,U251,SW620以及A673在KDSR敲除后细胞活性无明显变化;2、在MOLM13和MV4-11细胞中将KDSR敲除后,Annexin V和活性Caspase3检测均表明细胞凋亡明显增加,Ed U检测显示S期细胞明显减少,有明显统计学意义,提示细胞阻滞在G1/S期;3、细胞形态学及内质网形态检测发现内质网从长条状变成圆形,但分化不受影响;4、MOLM13和MV4-11细胞敲除KDSR后3-脱氢鞘氨酸(3-ketodihydrosphingosin,KDS)明显增加,鞘脂从头合成途径的其他鞘脂比如二氢鞘氨醇(Dihydrospingosin,DHS),二氢神经酰胺(Dihydroceramide,DHCer)以及神经酰胺(Ceramide,Cer)均有不同程度的增加,但无明显统计学意义,相反,参与补救合成途径的部分鞘脂例如糖化神经酰胺(Glycoceramide,Gly Cer)和鞘磷脂(Sphingomyelin)则相对下降,没有统计学意义;5、敲除KDSR后进行RNA-seq检测,通过GSEA分析显示KDSR在MOLM13和MV4-11中与未折叠蛋白反应(Unfolded protein response,UPR)通路密切相关,WB对其验证表明KDSR敲除后,UPR相关蛋白PERK,ATF6,ATF4均有明显下调,而IRE1α无明显变化,过表达KDSR后UPR相关蛋白表达明显回复;6、增加细胞中KDS的含量可模拟KDSR敲除,WB显示随着KDS浓度增加可明显下调UPR相关蛋白表达,但对其他细胞如293T无明显影响;7、增加细胞中KDS的含量MV4-11细胞中内质网从条状变成圆形,而293T细胞中内质网不受影响;8、在不同癌症细胞中进行内质网应激相关药物处理,发现白血病细胞对该类药物更敏感,药物处理后MV4-11细胞内质网形态发生显著变化,而293T细胞不受影响;9、在MV4-11和293T细胞中进行内质网应激药物处理,发现MV4-11细胞中UPR相关蛋白表达下调,而293T细胞中该类蛋白表达无明显变化;10、同时在敲除KDSR或增加KDS含量的基础上进行药物处理时,敲除KDSR或KDS积累可协同内质网应激药物的作用,降低细胞生存率。【结论】1、KDSR对白血病细胞的生存至关重要,但对其他癌症细胞无明显影响;2、敲除KDSR基因可明显增加细胞凋亡,细胞周期阻滞在G1/S期,内质网形态发生变化,但分化不受影响;3、敲除KDSR基因可增加鞘脂从头合成途径的鞘脂产生,同时使补救途径的鞘脂略下降;4、敲除KDSR可积累KDS并通过未折叠蛋白反应通路影响白血病发生发展;5、敲除KDSR或积累KDS可影响内质网形态变化从而影响白血病发生发展;6、与其他癌症细胞比较,白血病细胞对内质网应激相关药物更加敏感,敲除KDSR或者增加KDS能进一步增加白血病细胞对药物的敏感性。
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