中国小麦地方品种胚芽鞘生长动态的关联分析

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小麦(Triticum aestivum L.)是一种重要的粮食作物。胚芽鞘对小麦形态建成非常重要,也是小麦高产的基础。因此,解析小麦胚芽鞘生长规律,是提高小麦产量的重要途径之一。本研究以收集于我国10个生态农业区的697份地方小麦品种为材料,进行了连续6天的胚芽鞘长度测量,试验重复三次。利用逻辑回归建立的胚芽鞘生长曲线模型,评估胚芽鞘生长相关参数。通过分子标记进行全基因组关联分析,并对重要位点进行验证。最后结合小麦中国春的参考基因组数据,推测候选基因。本研究主要研究结果如下:1.方差分析结果显示,试验期间每天的胚芽鞘长度在基因型间存在着显著差异,胚芽鞘长度随着天数的增加而逐渐增加。胚芽鞘长度在第5天和在第6天之间差异不显著,说明胚芽鞘在第6天已经停止生长,长度达到最大值。2.利用龚珀兹回归和逻辑回归模型构建了胚芽鞘的生长曲线。结果显示,逻辑回归模型构建的曲线最优拟合度高于龚珀兹模型,且利用逻辑回归计算的胚芽鞘最终长度与第6天测量的胚芽鞘长度更为接近,呈现高度相关性。3.将胚芽鞘最终长度与8个农艺性状进行分析,发现其与抽穗期、开花期、旗叶长、旗叶宽、幼苗习性及穗长呈显著正相关关系,而与穗颈节长呈显著负相关。进一步分析发现,在株高较低的群体中胚芽鞘长度与株高是呈显著正相关的,而在株高较高的群体中无显著相关性,说明胚芽鞘在较高的株高群体中是独立遗传的。4.利用两种混合模型进行对胚芽鞘长度(6天)和生长相关参数进行了全基因组关联分析,结果显示,在显著水平-lg(p)≥4.72下,一共检测到21个标记,这些标记分布在小麦2B,2D,3B,4A,6A,6B和7D染色体上。其中,在4A和6B染色体上分别检测到一个与胚芽鞘长度相关的基因组热点区域。进一步通过开发HRM标记,在F2:3群体中验证了6B热点区域的遗传效应。5.对位于4A和6B染色体上的与胚芽鞘长度相关的热点区域内的基因进行了筛选。其中,6B热点区域上筛选到一个可能与胚芽鞘生长相关的基因Traes CS6B01G282600,这个基因与细胞的分裂和分化有关。而在4A热点区域上筛选到两个可能与胚芽鞘生长相关的基因Traes CS4A01G422900和Traes CS4A01G423500,这两个基因与乙烯调控途径有关。
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