‘JMS2’ × ‘交城5号’枣杂交后代高密度遗传图谱构建及果实大小、糖酸性状的QTL定位

来源 :塔里木大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jcm917
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高密度遗传图谱的构建是开展分子辅助育种研究的基础,但枣遗传图谱构建和分子标记辅助选择的研究明显落后于其他果树。本研究以140株‘JMS2’ב交城5号’杂交F1代为试验材料,采用全基因组重测序技术(WGS,Whole Genome Sequencing),利用SNP和In Del标记,构建枣树高密度遗传图谱。连续2年调查果实大小、糖组分、酸组分等14个果实性状,并对调查性状进行QTL定位分析。取得主要结论如下:1.基于全基因组重测序技术,构建了一张枣高密度遗传图谱。该图谱包含12个连锁群,8684个上图标记,图谱总图距为1713.22c M,平均图距为0.20c M。2.连续2年调查的14个果实大小和糖酸性状的变异系数在12.48%-41.75%之间,说明这些性状在子代个体间存在广泛的分离;调查性状的次数分布图均符合正态分布,是受多基因调控的数量性状。3.使用R/qtl的区间作图法进行QTL定位,以LOD值≥3.0为QTL效应的临界值,14个果实性状共得到104个QTL位点,包括果实大小相关QTL位点57个、果实糖组分相关QTL位点17个、果实酸组分相关QTL位点30个。其中,检测到单果重的QTL位点14个、果实纵径的QTL位点11个、果实横径的QTL位点21个、果形指数的QTL位点11个;果糖的QTL位点6个、葡萄糖的QTL位点7个、蔗糖的QTL位点4个;草酸的QTL位点4个、酒石酸的QTL位点7个、奎宁酸的QTL位点6个、苹果酸的QTL位点2个、柠檬酸的QTL位点1个、富马酸的QTL位点7个、抗坏血酸的QTL位点3个。4.不同性状的QTL存在相同区间的遗传区段共23个。其中,果实横径与单果重重合区间11个;果实纵径与单果重重合区间3个;果实横径、果实纵径、单果重重合区间2个;果实纵径与果形指数重合区间1个;葡萄糖与果糖重合区间4个;果糖、葡萄糖、蔗糖重合区间1个;苹果酸与酒石酸重合区间1个。
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