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目的：探讨基质金属蛋白酶(MMP-9)基因多态性及其与吸烟的交互作用和新疆维吾尔族人群心肌梗死(MI)的相关性。方法：选择经皮冠状动脉造影检查确诊的维吾尔族心肌梗死患者384例(病例组),以同期冠脉造影阴性、排除冠心病诊断的451例维吾尔族个体为对照组。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法对MMP-9基因-1562C>T(rs3918242)、R279Q(rs 17576)和R668Q(rs17577)三个单核苷酸多态性位点(SNP)多态性进行分析,并进行单倍型的构建,比较两组间MMP-9基因多态性频率分布的差异,并结合造影情况,探讨MMP-9基因多态性及其与吸烟的交互作用和MI发生及冠脉狭窄程度的关系。结果：(1)MMP-9基因-1562C>T位点,病例组和对照组各基因型分布的比较差异具有统计学意义(χ2=9.054,P=0.011)。CT+TT基因型频率(25.52%)高于对照组CT+TT基因型频率(17.29%),差异具有统计学意义(χ2=8.437,P=0.004)；T等位基因频率比较发现,病例组(14.19%)也高于对照组(9.31%),差异也有统计学意义(χ2=9.665,P=0.002)。(2)R279Q位点,病例组与对照组RR、RQ及QQ基因型频率分别为48.18%、39.06%、12.76%和52.99%、37.03%、9.98%,两组比较差异未见统计学差异(χ2=2.600,P=0.273)。病例组RQ+QQ基因型和Q等位基因频率均高于对照组,但是差异未见统计学差异(均P>0.05)。(3)对于R668Q位点,病例组与对照组RR、RQ及QQ基因型频率分别为67.71%、27.34%、4.95%和73.84%、22.39%、3.77%,两组比较差异未见统计学差异(χ2=3.824,P=0.148)。但病例组RQ+QQ基因型频率高于对照组,差异未见统计学意义(χ2=3.784,P=0.052)。等位基因的比较也表明病例组Q等位基因的频率(18.62%)也高于对照组的14.97%,差异显示弱统计学意义(χ2=3.989,P=0.046)。(4)病例组不同冠脉累及支数亚组之间-1562C>T、R279Q和R668Q三个SNP位点基因型及等位基因频率分布比较差异均未见统计学意义(均P>0.05)。(5)单因素分析发现-1562T等位基因(CT/TT基因型)且吸烟的个体相对于-1562CC基因型且不吸烟者发生心肌梗死的相对风险比值OR为3.64(P<0.01)。多因素Logistic回归分析显示-1562T等位基因与吸烟的交互作用是心肌梗死发生的独立风险因素(OR=4.42,95% CI：2.14-7.13；P<0.01),OR值大于-1562T等位基因和吸烟二者各自的独立作用。(6)3个SNP位点成功构建8个单单体型,总的单体型分布在病组组和对照组之间比较差异具有统计学意义(χ2=21.743,P<0.001)。C-G-A单体型频率在病例组(5.8%)明显低于对照组(12.8%),差异具有统计学意义(P<0.01)；而T-A-G单体型分布在病例组(4%)显著高于对照组(2.2%),差异具其有统计学意义(P=0.029)。相对风险分析显示携带C-G-A单体型者发生心肌梗死的风险将降低(OR=0.431,95% CI：0.301-0.618)；携带T-A-G单体型者发生心肌梗死的风险升高约1.87倍(OR==1.873,95% CI：1.057-3.316)。(7)多因素Logistic回归分析显示糖尿病、高血压、吸烟、总胆固醇是心肌梗死发生的独立风险因素,在校正其他传统风险因素作用后发现MMP-9基因-1562T等位基因(CT或TT基因型)仍是心肌梗死发生的独立风险因素(OR=1.31,95% CI：1.221-1.404；P=0.018)。携带T-A-G单体型者发生心肌梗死的风险性明显增加(OR=1.60,95% CI：1.13-2.26；P=0.008)。结论：(1)MMP-9基因-1562C>T多态性可能与新疆维吾尔族人群心肌梗死发生具有相关性；-1562T等位基因可能是MI遗传易感性的基因标记之一。(2)对于本研究人群,MMP-9基因R279Q和R668Q多态性与心肌梗死的发生未见明显相关。(3)MMP-9基因-1562C>T、R279Q和R668Q多态性与新疆维吾尔族心肌梗死冠脉病变狭窄程度无关。(4)MMP-9基因-1562C>T多态性与吸烟在新疆维吾尔族心肌梗死的发生过程中存在协同效应。(5)MMP-9基因T-A-G单体型可能是新疆维吾尔族人群心肌梗死发生的易感标志,而C-G-A单体型可能是新疆维吾尔族人群心肌梗死发生的保护因素。