鮸鱼SOCS1及SOCS3基因特征及调控功能研究

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脊椎动物在感染微生物和病原体时依靠免疫系统消除感染性病原体,免疫系统由先天免疫和获得性免疫组成。天然免疫系统是宿主防御的最普遍形式,是抵御病原体入侵的第一道防线。细胞因子信号转导抑制蛋白(suppressors of cytokine signaling,SOCS)首先被描述为细胞因子信号转导抑制剂,在免疫系统中起着至关重要的作用。自从SOCS家族的第一个成员被发现,在哺乳动物中已经发现8个SOCS家族成员,包括CISH,SOCS1-7。然而,在鱼类中发现了几种鱼类中独有的成员,包括SOCS1b、SOCS3b、SOCS5b、SOCS8以及SOCS9。SOCS1和SOCS3在哺乳动物中研究广泛,但在鱼类中研究很少。本文中,我们鉴定了鮸鱼中的SOCS1a、SOCS1b、SOCS3a和SOCS3b基因。然后对这4个基因进行了基因特征及表达模式分析和调控功能的研究。(1)对鮸鱼SOCS1a研究发现,mmSOCS1a全长为3111 bp,cDNA序列长度为1993bp,有2个外显子和1个内含子。通过与其他物种SOCS1a相比,鮸鱼的SOCS1a有一个高度保守的中央SH2结构域和一个相对保守的C端的SOCS box结构域。基因共线性分析表明,鮸鱼SOCS1a与其他鱼类有很高的共线性。表达模式分析表明,鮸鱼SOCS1a在肝脏和脾脏中表达量最高;感染实验中,鮸鱼SOCS1a在肝脏、肾脏和巨噬细胞中高度表达。双荧光素酶报告基因检测结果表明,mmSOCS1a能够抑制poly(I:C)、IFNγ及IFNα诱导的ISRE的活性。(2)对鮸鱼SOCS1b研究发现,mm SOCS1b全长为3780 bp,其cDNA序列全长为1990bp,有3个外显子和2个内含子。通过与其他物种SOCS1b相比,鮸鱼的SOCS1b只有一个高度保守的中央SH2结构域。基因共线性分析表明,鮸鱼SOCS1b与其他鱼类有很高的共线性。表达模式分析表明,鮸鱼SOCS1b在脾脏和肠中表达量最高;感染实验中,鮸鱼SOCS1b在脾脏和肾脏中高度表达。双荧光素酶报告基因检测结果表明,mm SOCS1b能够抑制IFNγ和IFNα诱导的ISRE的活性。(3)对鮸鱼SOCS3a研究发现,mmSOCS3a全长为2576bp,cDNA序列长度为2010 bp,有2个外显子和1个内含子。通过与其他物种SOCS3a相比,鮸鱼的SOCS3a有一个高度保守的中央SH2结构域、一个相对保守的C端的SOCS box结构域和一个多变的N端区域。基因共线性分析表明,鮸鱼SOCS3a与其他鱼类有很高的共线性。表达模式分析表明,鮸鱼SOCS3a在肝脏和皮肤中表达量最高;感染实验中,鮸鱼SOCS3a在肝脏、肾脏和脾脏中高度表达。双荧光素酶报告基因检测结果表明,mm SOCS3a能够抑制IFNγ诱导的ISRE的活性。(4)对鮸鱼SOCS3b研究发现,mmSOCS3b全长为2686bp,cDNA序列全长为1787 bp,有3个外显子和2个内含子。通过与其他物种SOCS3b相比,鮸鱼的SOCS3b有一个高度保守的中央SH2结构域、一个相对保守的C端的SOCS box结构域和一个多变的N端区域。基因共线性分析表明,鮸鱼SOCS3b与其他鱼类有很高的共线性。表达模式分析表明,鮸鱼SOCS3b在肝脏和肾脏中表达量最高;感染实验中,鮸鱼SOCS3b在脾脏、肾脏和脾脏中高度表达。双荧光素酶报告基因检测结果表明,mm SOCS3b能够抑制IFNα诱导的ISRE的活性。
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