基金管理公司在证券投资基金业的发展组织体系中处于重要地位，基金管理公司的发展程度往往可以决定一国证券投资基金业的发展程度。一方面，基金管理公司的发展得到了市场和投资的青睐和认可，另一方面，基金管理公司的内部治理问题也伴随着基金管理公司的不断发展而显现出来，对其发展造成了困境。2013年6月颁布的《证券投资基金法》拓展了基金管理公司治理的空间，基金管理公司应及时地完善公司的治理结构。对基金管理公司治理结构的完善是证券投资基金行业发展的需求，同时也是保护基金份额持有人的需要。对我国基金管理公司治理结构与发展问题的研究不仅有重要的理论意义，还有重要的现实意义。本文通过先对基金管理公司进行基本的概况介绍、逐块分析基金管理公司内部治理结构的现状及其存在的问题，并在分析之后针对具体的治理结构提出完善的对策建议。　　论文包括四个部分。第一部分:“基金管理公司治理概述”首先通过分析基金管理公司的治理原因和基金管理公司治理的内涵;其次在此基础之上再分析基金管理公司治理的基本目标;最后阐述基金管理公司治理适用的一般法律规范、特殊法律规范及一些影响基金管理公司治理的其他因素，为论文的后续部分提供基础的背景铺垫。　　“维护基金份额持有人的利益是基金管理公司发展的基石”，通过分析基金管理公司发展过程中基金份额持有人利益至上的宗旨，基金管理公司最基本的原则与目标即优先保护基金份额持有人的利益，对这一原则与目标产生的原因的分析，以及基金管理公司的相关利益主体与基金份额持有人在总体利益上是一脉相承的。　　第二部分“基金管理公司股权结构治理问题研究”，分别阐述我国基金管理公司目前股权结构的现状及成因，并在此基础之上提出完善的建议，对目前法律关于主要股东的资格限制的利弊分析及建议。　　第三部分“基金管理公司各内部监督机制治理问题研究”，主要涉及独立董事制度、监事制度和督察长制度存在的现状及必要性，分析其不足并提出必要的建议。　　第四部分“基金管理公司经营层法律规制问题研究”，分析基金管理公司经营层进行规制的必要性及法律规制的现状并加强对经营层的约束机制和激励机制。